使用knitr创建HTML幻灯片和单独的R代码文件

Question

接下来是这个问题 ……如果我想输出一个单独的R代码文件，我不确定在哪里设置knitr选项。 以下内容在我的工作目录中未提供预期的其他.R文件。

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output: ioslides_presentation
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```{r setup, include=FALSE}
library("knitr"); purl("myfile.rmd")
#library("knitr"); knit("test_tangle.Rmd", tangle = TRUE)
#opts_knit$set(tangle=TRUE)
```

## Slide with Plot
```{r, echo=TRUE}
plot(cars)
```

但是错误消息...

Quitting from lines 6-7 (myfile.rmd) 
Error in readLines(if (is.character(input2)) { : 
  cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> purl -> knit ->     readLines
Execution halted

Answer 1

我建议您改用hook_purl函数。 函数purl() （或等效地， knit(tangle = TRUE) ）在某些情况下可能无法工作，并且钩子函数hook_purl()更可靠。 有关更多信息，请参见?hook_purl 。

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output: ioslides_presentation
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```{r setup, include=FALSE}
library("knitr")
knit_hooks$set(purl = hook_purl)
```

## Slide with Plot
```{r, echo=TRUE}
plot(cars)
```

然后，当您编织文档时，将自动生成R脚本。