使用-knitr-在RStudio中编织Rnw文件

Question

这似乎是一个经常出现的问题，谁愿意在RStudio使用knitr编写动态文档（例如也参见此处 ）。 不幸的是，我没有在Stack Overflow上找到解决方案，也没有通过Google搜索更多。

这是我试图在RStudio中编译的玩具示例。 它是minimal-example-002.Rnw （ 链接 ）：

\documentclass{article}
\usepackage[T1]{fontenc}

\begin{document}

Here is a code chunk.

<<foo, fig.height=4>>=
1+1
letters
chartr('xie', 'XIE', c('xie yihui', 'Yihui Xie'))
par(mar=c(4, 4, .2, .2)); plot(rnorm(100))
@

You can also write inline expressions, e.g. $\pi=\Sexpr{pi}$, and \Sexpr{1.598673e8} is a big number.

\end{document}

我的问题是我无法使用knitr在RStudio编译pdf，而通过将默认编织选项更改为sweave我得到了最终的pdf。

更具体地说，我使用Windows 7，最新的RStudio版本（0.98.1103），我使用knitr选项编织文件，并禁用“始终启用Rnw一致性”框。

这件事发生在你身上吗？ 非常感谢任何帮助，非常感谢。

编辑

显然它不是一个RStudio问题，因为我试图从R编译文档：

library('knitr')
knit('minimal_ex.Rnw')

我得到同样的错误：

processing file: minimal_ex.Rnw

  |                                                                       
  |                                                                 |   0%
  |                                                                       
  |......................                                           |  33%
  ordinary text without R code


  |                                                                       
  |...........................................                      |  67%
label: foo (with options) 
List of 1
 $ fig.height: num 4

Quitting from lines 8-10 (minimal_ex.Rnw) 
Errore in data.frame(..., check.names = FALSE) : 
  arguments imply differing number of rows: 3, 0
Inoltre: Warning messages:
1: In is.na(res[, 1]) :
  is.na() applied to non-(list or vector) of type 'NULL'
2: In is.na(res) : is.na() applied to non-(list or vector) of type 'NULL'

编辑2：

这是我的会话信息：

R version 3.1.1 (2014-07-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=Italian_Italy.1252  LC_CTYPE=Italian_Italy.1252    LC_MONETARY=Italian_Italy.1252 LC_NUMERIC=C                  
[5] LC_TIME=Italian_Italy.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] knitr_1.10.5

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.1.1

Answer 1

在花了好几个小时试图找出问题之后，我更新了R（v 3.2.0），现在一切正常。 目前尚不清楚这个问题是否是由于某些软件包冲突造成的，当然这不是一个RStudio问题（正如我最初想的那样）。

Answer 2

添加一点：这似乎是echo参数的一个错误，默认为TRUE 。 使用knitr和pdfLaTeX作为渲染器将其设置为false对我pdfLaTeX 。 如果您因为依赖性和/或权限问题而无法更新，则此输入可能是一个有用的特殊修复，因为错误消息非常无用。