R中使用cdfextract时出错（clim.pact程序包）

Question

我在使用R时还很陌生，目前正在尝试使用它来提取netCDF文件特定区域的数据并将其转换为csv。 最终，我希望对自己感兴趣的每个变量有一个时间序列。

我已经下载了R的ncdf和clim.pact软件包，并且由于我的netCDF文件很大（25年的每日数据），我认为我应该能够使用cdfextract提取感兴趣区域的数据，然后我会将那个较小的文件转换为csv。 但是，尝试运行该错误时，我总是遇到相同的错误。 这是我一直在使用的脚本以及出现的错误：

cdfextract("file.nc","tas", x.rng=c(-93, -85), y.rng=c(16, 23),t.rng=c(1, 9125))

[1]“ time.origin = 01 Jan 0850”系统错误（“ rm -f cdfcont.txt”，内部= TRUE）：找不到'rm'

凡我的文件是file.nc和感兴趣的变量是tas 。 我认为这可能与时间格式有关，但是当我检查文件的时间单位时，它说的是“自0850年1月1日以来的天数”，因此我认为单位是正确的。

无论如何，对此问题的任何评论都将受到欢迎！ 谢谢！

Answer 1

如果不必使用R，则可以使用NCO软件包中的ncks ： http : ncks

ncks是一个很棒的命令行工具，用于从netCDF文件中提取数据。 通常，您可以提取特定纬度/经度波段上的变量，然后使用以下方法将数据输出到.csv文件中：

ncks -v tas -d lat,16.,23. -d lon,-93.,-85. -s '%f\n' file.nc > output.csv

我无法告诉您是否要先对tas进行面积平均，然后再在.csv文件中获取该面积平均量的时间序列。 如果是这样，则需要首先使用ncwa进行平均区域： http : ncwa