[英]R: DEoptim parallel optimization - number of cores
我正在尝试在 R 中使用DEoptim
优化包来解决连续优化问题,并且由于我的成本函数需要很长时间来评估(2 分钟),我正在尝试使用并行计算。 我的问题是:
paralleltype=1
( parallel
) 和2
( foreach
) 选项有什么区别? 何时使用两者之一?
是否可以使用paralleltype=1
指定内核数,以便不使用所有可用内核进行计算(例如,64 个内核中有 50 个内核可用)?
广告。 1 - 它在包文档中进行了解释。
广告。 2 - 需要修改两个函数:DEoptim.control 和 DEoptim
首先,将一个变量——比如limitCores——添加到 DEoptim.control 函数中,该函数控制 DE 优化的执行参数。
其次,对 DEoptim 包装函数进行修改,以对 limitCores 设置的限制起作用。
if (ctrl$parallelType == 1) {
if (!is.na(ctrl$limitCores)) {
if (ctrl$limitCores<1) useCores <- round(parallel::detectCores()*ctrl$limitCores) else useCores <- ctrl$limitCores
cl <- parallel::makeCluster(parallel::detectCores())
} else {
cl <- parallel::makeCluster(parallel::detectCores())
}
完整代码: http : //pastebin.com/NumDx4ae
感谢您的代码 mjaniec!
我知道你发布它已经有一段时间了,但我认为在第 91 行应该是:
cl <- parallel::makeCluster(useCores)
代替:
cl <- parallel::makeCluster(parallel::detectCores())
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