向条形图添加误差线

Question

我有两个向量。 我想制作第一个向量的小样图（足够简单，正确）。 扭曲之处在于，第二个向量的每个元素都是第一个向量的每个元素的标准偏差（它本身是其他4个值的平均值）。 我怎样才能做到这一点？

有问题的向量：

-4.6521175 0.145839723
 1.1744100 0.342278694
-0.2581400 0.003776341
-0.3452675 0.073241199
-2.3823650 0.095008502
 0.5625125 0.021627196

即，如何将第二列向量的元素作为误差线添加到第一列向量中的相应元素？

注意：是的，在您问之前，是的，我确实在该站点上进行了广泛的搜索，并且进行了大量的谷歌搜索，但是我的问题是更具体的，即我发现的内容与我的需求不符。

Answer 1

我个人最喜欢这类图形的arrows() ：

df <- data.frame(bar = c(-4.6521175, 1.1744100, -0.2581400,  -0.3452675, -2.3823650, 0.5625125),
error = c(0.145839723, 0.342278694, 0.003776341, 0.073241199, 0.095008502, 0.021627196))

foo <- barplot(df$bar,ylim=c(-6,2),border=NA)
arrows(x0=foo,y0=df$bar+df$error,y1=df$bar-df$error,angle=90,code=3,length=0.1)

两个细节：

1. barplot()中的border=NA会删除小节周围的边框，因此您实际上可以在第三小节周围看到错误信息。 由于第三个误差非常小，因此晶须几乎位于条形边框的顶部。

2. 我在arrows()使用了length参数来减小水平晶须的宽度，这在我们拥有更多条形的情况下尤其重要。 默认值为length=0.25 。

但是，请注意， “炸药地块”具有主要缺点 。 您写道，每个条形图的数据仅来自四个原始点。 在这种情况下，仅绘制原始数据的（抖动）点图几乎可以肯定会更好。

Answer 2

geom_bar和geom_errorbar的ggplot2 ：

library(ggplot2)
ggplot(df, aes(x=row.names(df), y=V1)) +
  geom_bar(stat="identity", fill="grey") +
  geom_errorbar(aes(ymin = V1 - V2, ymax = V1 + V2), width=0.6) +
  theme_classic() 

结果是：

如果要删除x轴上的数字，可以添加：

  theme(axis.title.x=element_blank(),
        axis.text.x=element_blank(),
        axis.ticks.x=element_blank())

到您的ggplot代码。

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使用的数据：

df <- read.table(text="-4.6521175 0.145839723
 1.1744100 0.342278694
-0.2581400 0.003776341
-0.3452675 0.073241199
-2.3823650 0.095008502
 0.5625125 0.021627196", header=FALSE)

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为了回应您的评论 ，当您要绘制大量条形图时，有两种可能的解决方案：

1：仅包括轴标签的选择：

ggplot(df2, aes(x=as.numeric(row.names(df2)), y=V1)) +
  geom_bar(stat="identity", fill="grey", width=0.7) +
  geom_errorbar(aes(ymin = V1 - V2, ymax = V1 + V2), width=0.5) +
  scale_x_continuous(breaks=c(1,seq(10,200,10)), expand=c(0,0)) +
  theme_classic() +
  theme(axis.text.x=element_text(size = 6, angle = 90, vjust = 0.5))

这给出了：

可以看出，在情节中填充如此多的条形图并不理想。 因此，见备选案文2。

2：创建可用于创建构面的分组变量：

df2$id <- rep(letters[1:20], each=10)

ggplot(df2, aes(x=as.numeric(row.names(df2)), y=V1)) +
  geom_bar(stat="identity", fill="grey", width=0.7) +
  geom_errorbar(aes(ymin = V1 - V2, ymax = V1 + V2), width=0.5) +
  scale_x_continuous(breaks=as.numeric(row.names(df2))) +
  facet_wrap(~ id, scales = "free_x") +
  theme_bw() +
  theme(axis.text.x=element_text(angle = 90, vjust = 0.5))

这给出了：

最后两个示例使用的数据：

df2 <- data.frame(V1=sample(df$V1, 200, replace=TRUE),
                  V2=sample(df$V2, 200, replace=TRUE))