在矩阵中找到 3 个最短距离

Question

我有一个站点的对角线距离矩阵，如下所示

     head(distancematrix)
          15001     15002    15003    15004     15005     15008     
15001    0.0000  252.9474 390.4716 858.7412 1082.2168 1262.6803 
15002  252.9474    0.0000 164.8057 608.5672  834.7632 1033.4702 
15003  390.4716  164.8057   0.0000 477.9417  755.8448  990.6740 
15004  858.7412  608.5672 477.9417   0.0000  370.3795  668.1066 
15005 1082.2168  834.7632 755.8448 370.3795    0.0000  303.5589 
15008 1262.6803 1033.4702 990.6740 668.1066  303.5589    0.0000  

我希望能够获得连续每个站点的数据框以及 3 个最短站点的距离。

site  s1       s2        s3
15001 252.9474 390.4716 858.7412
15002 164.8057 608.5672  834.7632

Answer 1

您可以尝试使用应用程序。 在这种情况下，我们对每一行进行排序，并取第二到第四个值 - 最低的是您已排除的 0。 第 2 行的输出与您的示例不匹配，因为您错过了 252.9474 点：

t(apply(dat, 1, function(x){sort(x)[2:4]}))

          [,1]     [,2]     [,3]
15001 252.9474 390.4716 858.7412
15002 164.8057 252.9474 608.5672
15003 164.8057 390.4716 477.9417
15004 370.3795 477.9417 608.5672
15005 303.5589 370.3795 755.8448
15008 303.5589 668.1066 990.6740