[英]How to plot aggregate results after groupby in Pandas?
我最近开始学习 Pandas,但在使用groupby和agg后如何绘制结果时遇到了一些麻烦。 使用 Pandas,我创建了一个数据框,并根据两列“ID”和“x”对其进行分组。 然后我从组中选择了一个特定的列(“结果”)来计算 sem 和平均值。
具体来说,代码:
df = pd.read_csv('pandas_2015-11-7.csv')
df_group = df.groupby(['x','ID'])['results']
df_group_results = df_group.agg([stats.sem, np.mean])
结果如下所示:
sem mean
x ID
2.5 0 0.010606 0.226674
1 0.000369 0.490820
2 0.000508 0.494094
5.0 0 0.001672 0.005059
1 0.012252 0.190962
2 0.003696 0.170342
7.5 0 0.001630 0.004506
1 0.002567 0.016109
2 0.002081 0.047301
10.0 0 0.000000 0.000000
1 0.000000 0.000000
2 0.000000 0.000000
12.5 0 0.000000 0.000000
1 0.000000 0.000000
2 0.000000 0.000000
我的问题是如何根据这些结果制作带有误差线的线图? x 轴应基于 'x' 值,而 'ID' 确定行(在本例中为 3 行,图例分别为 0、1 和 2)。 我想要实现的理想情节是这样的
(来源: matplotlib.org )
.
groupby() 方法返回一个分层索引(多索引):
http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/advanced.html
如果我创建一个具有类似分层索引的 df:
import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'mean':[0.5,0.25,0.7,0.8],'sem':[0.1,0.1,0.1,0.2]})
df.index = pd.MultiIndex(levels=[[2.5,5.0],[0,1]],labels=[[0,0,1,1],[0,1,0,1]],names=['x','ID'])
然后我有以下df:
mean sem
x ID
2.5 0 0.50 0.1
1 0.25 0.1
5.0 0 0.70 0.1
1 0.80 0.2
我可以从多索引中获取相关信息,并使用它来按顺序选择和绘制正确的行:
x_values = df.index.levels[0]
ID_values = df.index.levels[1]
for ID in ID_values:
mean_data = df.loc[[(x,ID) for x in x_values],'mean'].tolist()
error_data = df.loc[[(x,ID) for x in x_values],'sem'].tolist()
matplotlib.pyplot.errorbar(x_values,mean_data,yerr=error_data)
legend(ID_values)
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