为什么阿多尼斯是“不正确的（无分层）”？

Question

我正在学习如何做PERMANOVA ，当我从示例开始时，这确实是一个挑战。 以下代码来自adonis的帮助页面。 我可以看一下示例，但无法弄清楚为什么它是incorrect (no strata) ？ 这是否意味着我必须获取地层数据才能使用adonis ？

data(dune)
data(dune.env)

### Example of use with strata, for nested (e.g., block) designs.
dat <- expand.grid(rep=gl(2,1), NO3=factor(c(0,10)),field=gl(3,1) )
Agropyron <- with(dat, as.numeric(field) + as.numeric(NO3)+2) +rnorm(12)/2
Schizachyrium <- with(dat, as.numeric(field)-as.numeric(NO3)+2) +rnorm(12)/2
Y <- data.frame(Agropyron, Schizachyrium)
mod <- metaMDS(Y)
plot(mod)

### Hulls show treatment
with(dat, ordihull(mod, group=NO3, show="0"))
with(dat, ordihull(mod, group=NO3, show="10", col=3))

### Spider shows fields
with(dat, ordispider(mod, group=field, lty=3, col="red"))

### Correct hypothesis test (with strata)
adonis(Y ~ NO3, data=dat, strata=dat$field, perm=999)

### Incorrect (no strata)
adonis(Y ~ NO3, data=dat, perm=999)

Answer 1

在PERMANOVA ， PER位代表置换测试。 仅当您随机整理在研究实验设计下真正可交换的样本时，置换测试才有效。 在这种情况下，例如使用封闭的研究，因此，如果你的水平内置换样本置换检验才有效strata永不水平之间的strata 。

这就是“ Incorrect (no strata) ”注释所指的内容； 这些数据的无限制排列测试不正确。