带或不带ggplot2的多面分组箱线图r

Question

我有一组超过10个阶段或几个月的实验。 我正在培养3种不同类型的细菌，并计算其生长（ACC）。

我正在尝试获取三种细菌类型（A，E和H）在不同阶段生长的facet_wrap分组箱线图。 我的资料：

head(EAH)
  ACC sample site bed phase X.M.SA TYPE
1  SG      A    1   0     1     NO    E
2  SG      A    2   0     1     NO    A
3  MG      A    3   0     1     NO    H
4  SG      A    4   0     1     NO    A
5  LG      A    1   0     2     NO    E
6  LG      A    2   0     2     NO    H

由于某些原因而无法使用的一些代表性数据：

EAH<- data.frame(ACC=factor(sample(1:5,10,replace=T), label=c("NG","SG","LG","MG","GH")), 
                 Phase=factor(seq(1,10,1)),
                 TYPE=factor(sample(1:3,10,replace=T), label=c("A","E","S"),replace=T))

我正在尝试ggplot2，尽管如果没有它也可以完成。

ggplot(EAH, aes(x=as.factor(EAH$phase), y=EAH$ACC, group=EAH$TYPE)) + 
  geom_boxplot(aes(fill=factor(EAH$TYPE)))+ facet_grid(. ~ as.factor(EAH$phase))

到目前为止，这是我已经设法完成的工作，但无法理解：

类似于该帖子上的第3张图，看起来不错： ggplot：为连续x的每组安排多个y变量的箱形图

编辑

新代码即将结束，但我不得不将ACC更改为数字。 我可以在y轴上将标签取回为NG，SG，LG，MG，HG吗？

ggplot(EAH, aes(x=TYPE, y=as.numeric(ACC))) + 
  geom_boxplot(aes(fill=TYPE))+ facet_grid(. ~ phase)

最终代码：

library(RColorBrewer)
library(ggplot2)
ggplot(EAH, aes(x=TYPE, y=as.numeric(ACC))) + 
  geom_boxplot(aes(fill=TYPE))+ 
  facet_grid(. ~ phase) +
 labs(x = "Phase", y = "Growth",color="Type" )+
 scale_fill_brewer(palette="Blues")+
 theme_bw()+
 theme(strip.background=element_rect(fill="black"))+
 theme(strip.text=element_text(color="white", face="bold"))+
scale_y_discrete(breaks=c("1", "2", "3","4","5"),
                   labels=c("NG", "SG", "LG","MG","HG"))

结果：

Answer 1

ggplot2使用非标准评估。 它在传递到其data参数的data.frame中寻找变量。 因此，您可以简单地执行以下操作：

ggplot(EAH, aes(x=Phase, y=ACC)) + 
  geom_boxplot(aes(fill=TYPE))+ facet_grid(. ~ Phase)

当然，R是区分大小写的。