将顶点属性添加到python中的加权igraph图

Question

我正在学习python-igraph，并且难以处理分成组件（它们之间没有连接）的图形。 当我在此图上应用其中一个聚类算法时，它似乎无法正常工作，因此我需要将算法分别应用于每个子图（组件）。 所以为了保持顶点的识别，我想添加一个顶点属性，它给出了原始图中的id号。 我的图是从加权邻接矩阵构造的：

import numpy as np
import igraph

def symmetrize(a):
    return a + a.T - 2*np.diag(a.diagonal())

A = symmetrize(np.random.random((100,100)))

G = igraph.Graph.Adjacency(A.tolist(),attr="weight",mode="UPPER")

我看到应该有一种方法来添加顶点属性 ，但我不明白如何使用它。

Answer 1

向所有顶点添加顶点属性的方式如下：

G.vs["attr"] = ["id1", "id2", "id3", ...]

您还可以将顶点属性附加到单个顶点：

G.vs[2]["attr"] = "id3"

例如，如果您只需要所有顶点的唯一标识符，则可以执行以下操作：

G.vs["original_id"] = list(range(G.vcount()))

（如果您使用的是Python 2.x，则不需要list()部分，因为range()已生成列表）。