bash输入输入并选择文件

Question

ubuntu 14.04的下面bash提示用户输入，然后要求用户在select使用该文件。 但是，我只能选择其中一个文件，因为尽管目录中有3个文件，但只有1个文件被标记。 但是，如果我将select文件放在输入之前， bash似乎可以工作。 我似乎无法解决它，怎么了？ 谢谢。

重击

# enter gene input
printf "%s \n" "Please enter gene(s), use a comma between multiple:"
OLDIFS=$IFS
IFS=","
read -a genes
for (( i = 0; i < ${#genes[@]}; i++ ))
do
printf "%s\n" "${genes[$i]}" >> /home/cmccabe/Desktop/NGS/panels/GENE.bed
done

# select file
printf "please select a file to analyze with entered gene or genes  \n"
select file in $(cd /home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/bedtools;ls);do break;done
        echo $file "will be used to filter reads, identify target bases and genes less than 20 and 30 reads, create a low coverage bed for vizulization, and calculate 20x and 30x coverage for the entered gene(s)"
logfile=/home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/process.log
for file in /home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/bedtools/$file; do
 echo "Start selcted file creation: Panel: ${FUNCNAME[0]} Date: $(date) - File: $file"
 bname=$(basename $file)
 pref=${bname%%.txt}
 echo "End selected file creation: $(date) - File: $file"
 done >> "$logfile"

显示在终端

1) 12_newheader_base_counts.txt
   34_newheader_base_counts.txt
   56_newheader_base_counts.txt

所需的终端显示

1) 12_newheader_base_counts.txt
2) 34_newheader_base_counts.txt
3) 56_newheader_base_counts.txt

Answer 1

的的修改IFS事先打破的方式select考虑您的目录列表：与IFS=,它现在正在寻找通过分离项目,同时您的ls的输出由线分开饲料。

在select之前，应将IFS还原为其先前的值（ IFS=$OLDIFS ）。

另外，我建议使用外壳gloglo而不是列表子shell的输出：

select file in /home/cmccabe/Desktop/NGS/API/test/bedtools/*;

Answer 2

似乎您已将IFS值保存到OLDIFS，但随后没有还原它。 在select命令中使用的扩展要求将IFS恢复为其默认值。