我应该为MySQL数据库插入程序使用python类吗？

Question

我创建了一个数据库来存储NGS测序结果。 它由17个表组成，用于存储所有信息。 结果存储在电子表格中，我使用python（2.7）解析数据并将其存储在变量中，然后使用python包mysqldb将数据插入数据库中。 我主要使用函数来获取变量中所需的信息，然后编写一个循环，在其中调用此函数，然后插入“ try：”语句。 这是一个简单的示例：

def sample_processer(file):
    my_file = open(file, 'r+')
    samples = []
    for line in my_file:
        ...get info...
        samples.append(line[0])
    return(samples)

samples = sample_processor('path/to/file')

for sample in samples:
    try:
        sql = "samsql = "INSERT IGNORE INTO sample(sample_id, diagnosis, screening) VALUES ("
        samsql = samsql + "'"+sample+"'," +sam_screen_dict.get(sample)+"')"  
    except e: 
        db.rollback()
        print("Something went wrong inserting data into the sample table: %s" %(e))

* sam_screen_dict是我从另一个函数制作的字典。

这是我上载的简单表格，但其中许多表调用了不同的字典，以确保上载了正确的结果。 但是我想知道是否会有使用类的更健壮方法。

例如，我的s​​ample_id在样本表中具有关联的筛选属性，因此使用一本字典就很容易做到。 我有更复杂的联结表，例如其中存储了sample_id，experiment_id和发现的突变的表以及其他数据，为该表创建一个类，并调用一个简单的“ sample”类来创建一个类是一个好主意吗？继承？ 这样，我将永远知道插入的结果将用于正确的样本/实验等。

另外，可以使用类为每个属性编写规则，以便如果源电子表格由于某种原因不正确，它将不会插入数据库中？ 即：sample_id的格式为A123 / 16。 因此，使用类将检查第一个字符为“ A”，并且sample_id [-3]应始终=='/'。 我知道我可以将它们写到函数中，但是我觉得它会占用大量空间和时间来编写许多“ if”语句，因此如果将其存储在类中一次，那会更好。

有没有人做过类似的事情，使用类来传递变量以测试它们是否正确，然后再进入插入阶段并创建错误？

我是python类的新手，并且了解基本知识，但仍在尝试与之接触，因此朝着正确的方向发展将是一件很不错的事-有助于实际编写python类代码的任何帮助用于制作更强大的数据库插入程序。

Answer 1

17个表，这意味着您可以使用大约17个类。 使用一个简单的脚本。 webpy.db https://github.com/webpy/webpy/blob/master/web/db.py只需修改一些代码。 然后，您可以使用webpy api： http ://webpy.org/docs/0.3/api#web.db完成您的工作。

希望对您有用