使用sed或awk将字符串替换为下划线和点

Question

我有一堆文件的文件名由下划线和点组成，这是一个示例：

META_ALL_whrAdjBMI_GLOBAL_August2016.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz.r0-ADRL.GLND.FET-EnhA.out.params

我要删除包含.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz.的部分.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz. 因此预期的文件名输出应为META_ALL_whrAdjBMI_GLOBAL_August2016.r0-ADRL.GLND.FET-EnhA.out.params

我正在使用这些sed命令，但没有一个起作用：

stringZ=META_ALL_whrAdjBMI_GLOBAL_August2016.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz.r0-ADRL.GLND.FET-EnhA.out.params
echo $stringZ | sed -e 's/\([[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.\)//g'
echo $stringZ | sed -e 's/\[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.[[:lower:]]\.//g'

sed或awk的任何解决方案都会有很大帮助

Answer 1

不要将外部实用程序和正则表达式用于如此简单的任务！ 请改用参数扩展 。

stringZ=META_ALL_whrAdjBMI_GLOBAL_August2016.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz.r0-ADRL.GLND.FET-EnhA.out.params
echo "${stringZ/.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz}"

要重命名包含.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz的所有文件，请使用以下命令：

shopt -s nullglob
substring=.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz
for file in *"$substring"*; do
    echo mv -- "$file" "${file/"$substring"}"
done

注意。 我将echo放在mv前面，这样就不会重命名了。 命令将仅显示在您的终端上。 如果对看到的内容满意，请删除echo 。

Answer 2

正则表达式实际上并没有比固定模式更通用，但是如果要使其正常工作，则需要在每个点之间允许多个小写字符。 现在，您正在寻找的正是一个，但是您可以在每个[[:lower:]]之后用\\+修复它，例如

printf '%s' "$stringZ" | sed -e 's/\([[:lower:]]\+\.[[:lower:]]\+\.[[:lower:]]\+\.[[:lower:]]\+\.[[:lower:]]\+\.[[:lower:]]\+\.[[:lower:]]\+\.\)//g'

与哪个

stringZ="META_ALL_whrAdjBMI_GLOBAL_August2016.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz.r0-ADRL.GLND.FET-EnhA.out.params"

给我输出

META_ALL_whrAdjBMI_GLOBAL_August2016.r0-ADRL.GLND.FET-EnhA.out.params

Answer 3

尝试这个：

#!/bin/bash
for line in $(ls -1 META*);
do
f2=$(echo $line | sed 's/.bed.nodup.sortedbed.roadmap.sort.fgwas.gz//')
mv $line $f2
done