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源脚本以在R中分隔环境,而不是全局环境

[英]Source script to separate environment in R, not the global environment

是否有一种方法可以在R中对脚本进行source() ,使其作为父级附加到全局环境( .GlobalEnv )?

当前,当我提供脚本时,该脚本的所有变量和函数都出现在我的全局(交互)环境中。 我想在搜索路径中包括这些变量和函数,但不在.GlobalEnv 也就是说,我希望源脚本的行为类似于附加包,该附加包在全局环境和基本环境之间附加(请参阅Advanced R Environments中的图

在此处输入图片说明

像脚本一样打包脚本来获取脚本的最简单方法(即,在调用R脚本中定义的函数时, 词法作用域不会导致使用全局环境中定义的变量)。其父是.BaseNamespaceEnv ,然后使用该环境调用source()

例如,如果您具有如下脚本:

# << my-script.R >>
my_fun <- function(x){x + y}

然后在控制台上评估以下内容,不会产生错误,就像在自己的包中定义了my_fun一样:

source("my-script.R")
y = 2
my_fun(1)
#> 3

但是,如果创建一个环境,其search()路径不包括全局环境( .GlobalEnv ),则从脚本中调用该函数时,将得到正确的错误:

# Create the environment:
ENV = new.env(parent = .BaseNamespaceEnv)
# Attache it to the search path so that objects in your environment can be
# found from the global environment (i.e. from the console):
attach(ENV)
# do things:
source("my-script.R",ENV)
y = 2
my_fun(1)
#> Error in .ENV$my_fun(3) : object 'y' not found

我也想使用sys.source函数的解决方案。 使用envirtoplevel.env参数可以方便地绕过全局环境(IMHO)。 根据链接的文档:

sys.source [p] sys.source给定文件中的表达式,然后在指定的环境中连续对其求值。

tstEnv <- new.env()
sys.source(file = "tst.R", envir = tstEnv, toplevel.env = tstEnv)

其中tst.R包含:

a <- 1
b <- 1

结果:

ls(envir = .GlobalEnv)
# [1] "tstEnv"
ls(envir = tstEnv)
# [1] "a" "b"
tstEnv$a
# [1] 1

source文档中, local参数可以是一个确定在何处评估源表达式的环境。

这表明您可以创建一个新环境,运行将环境传递给local source ,然后attach环境attach到搜索路径。

或者,您可以使用attach和what=NULL来创建一个空环境,保存返回值,并将其传递给source local

tmp <- attach(what=NULL)
source('test.R', local=tmp)

或作为一行:

source('test.R', local=attach(NULL))

以下环境插入似乎可以实现所需的功能:

检查当前搜索路径:

search()
# [1] ".GlobalEnv"        "package:stats"     "package:graphics"
# [4] "package:grDevices" "package:utils"     "package:datasets"
# [7] "package:methods"   "Autoloads"         "package:base"

为source包添加新环境,并在source()时使用local参数:

myEnv <- new.env()    
source("some_other_script.R", local=myEnv)
attach(myEnv, name="sourced_scripts")

检查搜索路径:

search()
#  [1] ".GlobalEnv"        "sourced_scripts"   "package:dplyr"
#  [4] "package:stats"     "package:graphics"  "package:grDevices"
#  [7] "package:utils"     "package:datasets"  "package:methods"
# [10] "Autoloads"         "package:base"

请注意,我们获取资源后将 attach()到新环境中,以便在搜索路径中的脚本环境之后附加dplyr

我不确定我的答案是否与上面给出的答案有所不同,但是我使用以下代码:

if (!exists('.env')) .env <- new.env() # creates an environment in which to store functions
if ('.env' %in% search()) detach(.env) # detaches .env if it already exists; does not "erase" functions previously stored in .env
func <- "filenameWhereSourceCodeIsStored"
source(paste0("C:/Users/JT/R/Functions/", func, ".R"), .env)
attach(.env)

暂无
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