如何更改现有hdf5文件的块大小？

Question

我想研究hdf5中的数据块大小如何影响我们的性能，因此我想写一些东西，让我轻松更改包含多个数据集的现有文件的数据块大小，以便对性能进行概要分析。 我找不到很多相关信息，但是也许我没有在Google搜索中使用书面词汇。

是否可以不重复？ 如果没有，那就没问题。 我不确定这样做最直接的方法是什么。 任何和所有帮助表示赞赏！

我正在使用C＃和HDF5DotNet。 我知道该包装器不再受支持，我们计划尽快迁移到受支持的容器。 但这还没有发生。

谢谢！

Answer 1

我认为您可以使用h5repack工具。 您可以使用不同的存储选项克隆现有文件。

• https://support.hdfgroup.org/products/hdf5_tools/index.html
• https://support.hdfgroup.org/HDF5/doc/RM/Tools.html#Tools-Repack

h5repack-将HDF5文件复制到具有或不具有压缩/分块功能的新文件中

您可以使用它来执行以下操作：

1. 原始文件A。
2. 使用h5repack工具将A转换为文件B，并带有--layout = layout选项和所需的chunksize。
3. 根据需要使用文件B进行测试。
4. 删除文件B。
5. 从另一个小块大小重复步骤2。