用于计算包含xy坐标列表的数据帧中的所有点之间的距离的方法

Question

我确定之前已经回答了这个问题，但我无法找到生命中的线索！

我试图使用r来生成数据帧中xy坐标对之间所有距离的列表。 数据存储如下：

ID = c('1','2','3','4','5','6','7')
x = c(1,2,4,5,1,3,1)
y = c(3,5,6,3,1,5,1)
df= data.frame(ID,x,y)

目前我可以使用以下方法计算两点之间的距离：

length = sqrt((x1 - x2)^2+(y1 - y2)^2).

但是，我不确定下一步该去哪里。 我应该使用plyr或for循环中的东西吗？

谢谢你的帮助！

Answer 1

你试过吗？dist，你列出的公式是欧几里德距离

dist(df[,-1]) 

Answer 2

您可以使用自联接来获取所有组合，然后应用距离公式。 所有这一切都很容易使用tidyverse （Hadley Wickham的包装组合）：

# Load the tidyverse
library(tidyverse)

# Set up a fake key to join on (just a constant)
df <- df %>% mutate(k = 1) 

# Perform the join, remove the key, then create the distance
df %>% 
 full_join(df, by = "k") %>% 
 mutate(dist = sqrt((x.x - x.y)^2 + (y.x - y.y)^2)) %>%
 select(-k)

NB使用此方法，您还将计算每个点与其自身（以及所有其他点）之间的距离。 虽然过滤这些点很容易：

df %>% 
 full_join(df, by = "k") %>% 
 filter(ID.x != ID.y) %>%
 mutate(dist = sqrt((x.x - x.y)^2 + (y.x - y.y)^2)) %>%
 select(-k)

有关使用tidyverse软件包的更多信息，我建议使用R for Data Science或tidyverse 网站 。