将data.frame转换为矩阵（R），rownames（）错误

Question

我有一个93 x 28的data.frame（“ data.csv”），我想转换成矩阵以作进一步绘制，它看起来像这样：

SYMBOL  BT.20   CAL.51  MDA.MB.436  BT.549
A   3.039   4.908   3.865   3.818
B   4.349   5.399   6.071   5.313
C   7.509   8.091   6.48    6.660
D   3.429   4.394   3.622   3.873
E   3.369   6.716   3.557   3.346

编码

data <- read_csv("data.csv")
rnames <- data[,1]              # assign labels in column 1 to "rnames"  
mat_data <- data.matrix(data[,2:28])  # transform column 2 - end into a matrix
rownames(mat_data) <- rnames                  # assign row names

产生

ERROR: Error in `rownames<-`(`*tmp*`, value = list(SYMBOL = c("A", "B",  : 
  length of 'dimnames' [1] not equal to array extent

第1列没有重复的名称或缺少值

编辑：使用read.csv()代替，它可以正常工作

Answer 1

错误是指分配给行名的值是一个列表，并且其中包含单个向量的列表的“长度”为1，而不是向量的长度。 我无法说出为什么会发生这种情况，因为通常的行为是使[[]函数将单个列“拖放”到原子向量中。 像您一样，我希望rnames是长度为39的原子向量，但看来您需要使用它：

rownames(mat_data) <- unlist( rnames )              # assign row names

Rich和Apom比我有更好的眼睛。 该read_csv函数产生具有不同的类和除将具有相关联的提取功能的对象read.csv 。 由于您处于“ hadleyverse”中，因此您应该使用以下代码：

 rnames <- data[[1]]

该tibble -classed对象有不同的版本的[ -function不是做data.frames。 [[ -函数对于这两个类似乎作用相同。