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通过分组因子对data.frame中的矩阵列表列求和

[英]Sum a list column of matrices in a data.frame by grouping factor

我有一个dataframe ,其中一列是一个包含每行矩阵的列表,定义了该观察的转换矩阵。

library(tidyverse)
m <- matrix(1:4, ncol = 2)
d <- data_frame(g = c('a', 'a', 'b', 'b', 'b', 'c'),
                m = rep(list(m), 6))

这看起来像:

# A tibble: 6 × 2
      g             m
   <chr>        <list>
1     a <int [2 × 2]>
2     a <int [2 × 2]>
3     b <int [2 × 2]>
4     b <int [2 × 2]>
5     b <int [2 × 2]>
6     c <int [2 × 2]>

我想得出两个矩阵的列表, ab ,它们是每个相应分组因子的所有矩阵的总和。 我需要这种方法推广到任意数量的组,因为我不会提前知道分组因子的数量。

我已经尝试了by_slice并且do ,但我能设法输出的是所有矩阵的总和,或者仅仅ab矩阵的总和 - 不绑定在单个组中。

您可以通过将矩阵嵌套在组(使用tidyr的nest )中来创建,这将创建一个包含矩阵列表的列表列。 然后,您可以使用purrr的mapreduce来汇总每个组列表中的矩阵:

results <- d %>%
  nest(-g) %>%
  mutate(summed = map(data, ~ reduce(.$m, `+`)))

结果:

# A tibble: 3 × 3
      g             data        summed
  <chr>           <list>        <list>
1     a <tibble [2 × 1]> <int [2 × 2]>
2     b <tibble [3 × 1]> <int [2 × 2]>
3     c <tibble [1 × 1]> <int [2 × 2]>

summed列将在每个组中添加矩阵。


如果你想把它变成一个带有a / b / c矩阵项的命名列表,你可以这样做:

lst <- results$summed
names(lst) <- results$g
lst

或者:

results %>%
  select(-data) %>%
  spread(g, summed)

用另一种方式group_bysummarise ,并reduce

m_sum <- function(l) {
  reduce(l, `+`) %>% list()
}

group_by(d, g) %>%
  summarise(m_sum = m_sum(m)) %>%
  select(m_sum) %>%
  unlist(recursive = FALSE)

暂无
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