[英]Average line for 2D Histogram?
我是“ R”的新手,并且有一个问题。我目前正在研究在R上制作2D直方图。材料不一定重要,但是如何在2D直方图上绘制平均线。 我正在运行的代码是这样的:
load("mydatabin.RData")
# Color housekeeping
library(RColorBrewer)
rf <- colorRampPalette(rev(brewer.pal(11,'Spectral')))
r <- rf(32)
# Create normally distributed data for plotting
x <- mydata$AGE
y <- mydata$BP
df <- data.frame(x,y)
# Plot
plot(df, pch=16, col='black', cex=0.5)
这给了我一个散点图,然后将其转换为2D直方图:
library(ggplot2)
# Default call (as object)
p <- ggplot(df, aes(x,y))
h3 <- p + stat_bin2d()
h3
# Default call (using qplot)
qplot(x,y,data=df, geom='bin2d')
之后,我要做:
h3 <- p + stat_bin2d(bins=25) + scale_fill_gradientn(colours=r)
h3
添加颜色。
因此,从这里如何绘制数据的平均线。
如果有人可以告诉我如何使用mydatebin.RData绘制如下所示的热图:
谢谢。
您可以在ggplot2
使用geom_hline
或geom_vline
,将y / xintercept用作参数来绘制线。 在您的情况下,该参数可以是绘制平均线的一列的平均值。 有关示例,请参见代码。 我还尝试了两种不同的绘制2D直方图的方法。 尽管我删除了colorBrewer,但是您的看上去更好,更精确。
library(ggplot2)
# Create normally distributed data for plotting
x <- rnorm(10000)
y <- rnorm(10000)
df <- data.frame(x,y)
# stat_density2d way, with average lines
p1 <- ggplot(df,aes(x=x,y=y))+
stat_density2d(aes(fill=..level..), geom="polygon") +
scale_fill_gradient(low="navy", high="yellow") +
# Here go average lines
geom_hline(yintercept = mean(df$y), color = "red") +
geom_vline(xintercept = mean(df$x), color = "red") +
# Just to remove grid and set background color
theme(line = element_blank(),
panel.background = element_rect(fill = "navy"))
p1
# stat_bin2d way, with average lines
p2 <- ggplot(df, aes(x,y)) +
stat_bin2d(bins=50) +
scale_fill_gradient(low="navy", high="yellow") +
# Here go average lines
geom_hline(yintercept = mean(df$y), color = "red") +
geom_vline(xintercept = mean(df$x), color = "red") +
# Just to remove grid and set background color
theme(line = element_blank(),
panel.background = element_rect(fill = "navy"))
p2
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