Rmarkdown编织YAML LaTeX错误

Question

我正在尝试让一个脚本将Rmd文件编织到PDF文档中，并遇到一些错误。

我必须说，如果我在Rstudio中单击“编织”按钮，则文档编织会很好，但是如果使用以下命令，它将无法编织：

rmarkdown::render('diagnostic.Rmd',output_format = "pdf_document",
                  output_file = "diag.pdf")

我遇到的第一个错误来自代码的这一部分：

---
author: Zigo_datateam
date: "`r format(Sys.time(), '%d %B, %Y')`"
geometry: margin=1.6in
header-includes: "\\usepackage{fancyhdr} \\fancyfoot[CO,CE]{My footer}"
output: 
  pdf_document:
    toc: false
title: "Graphic Layout(Report)"

---

并且是：

   Error in yaml::yaml.load(string, ...) : 
  Scanner error: while scanning a simple key at line 4, column 1could 
  not find expected ':' at line 5, column 1

因此，如果我删除孔header-includes表达式，它似乎开始编织，但是随后我从该部分得到第二个错误（在第二个“ ---”之后）：

\addtolength{\headheight}{1.0cm}
\pagestyle{fancyplain}
\rhead{\includegraphics[height=1.2cm]{logo.png}}
\renewcommand{\headrulewidth}{0pt}

错误：

! Undefined control sequence.
<argument> \undefinedpagestyle 

l.130 ...headheight}{1.0cm} \pagestyle{fancyplain}

如何摆脱第一个错误而又没有第二个错误？

更新：我决定将所有页脚/页眉样式移到一个单独的文件，我的代码如下所示：

---
author: Zigo_datateam
date: "`r format(Sys.time(), '%d %B, %Y')`"
geometry: margin=1.6in
output: 
  pdf_document:
    includes:
      in_header: mystyles.sty
title: "Graphic Layout(Report)"
---

我之前提到的错误不再显示，但我仍然得到：

pandoc: Error producing PDF
Error: pandoc document conversion failed with error 43

Answer 1

在您的YAML中，使用

header-includes: 
  - \usepackage{fancyhdr} 
  - \fancyfoot[CO,CE]{My footer}

它应该工作。