在远程集群上运行matlab mfile

Question

我正在Matlab中求解非线性偏微分方程。 我的代码多次调用fft2和ifft2命令。 因此，我想使用集群的GPU来加快计算速度。 我已经使用gpuArray准备了gpu的代码并收集。 但是，我在集群使用方面非常幼稚，我唯一知道的是我应该使用使用腻子的ssh终端，并且集群上未安装Matlab，并且需要首先编译我的代码。 首先，我想知道如何编译我的Matlab代码，然后，第二，如何在此远程集群上运行此代码？ 命令是什么？

预先非常感谢您的帮助

Answer 1

首先，为了利用GPU，您需要将fft2(x)更改为gather(fft2(gpuArray(x))) 。 类似地， ifft2(x)变为gather(ifft2(gpuArray(x))) 。

假设您不是在谈论使用集群作为并行计算的工作程序，则可以使用格式为matlab -r 'myfunction'命令从Linux终端运行MATLAB命令。 请注意， myfunction.m必须存在于当前工作目录或MATLAB的默认路径中。

修改脚本以使用GPU后，将ssh进入集群，切换到包含脚本的目录，然后运行matlab -r命令。