在R中读取CSV时将列名称添加到数据帧

Question

我的目录中有多个.csv文件，它们没有列名。 所以在没有标题的情况下读取它们会出错

match.names（clabs，names（xi））中的错误：名称与以前的名称不匹配。

因此，出于这个原因，我想将列名称附加到这些csv文件中，并将它们全部组合到一个数据帧中，但是在读取它们时，我无法将列名称添加到这些csv文件中。 文件名就像test_abc.csv ， test_pqr.csv ， test_xyz.csv等。这是我尝试过的

temp = list.files(pattern="*.csv")
read_csv_filename <- function(filename){
  ret <- read.csv(filename,header = F)
  ret$city <- gsub(".*[_]([^.]+)[.].*", "\\1", filename) 
  ret
}

df_all <- do.call(rbind,lapply(temp,read_csv_filename))

如何在阅读时在此处向每个文件添加标题？

这是我在阅读时要添加的名称

colnames = c("Age","Gender","height","weight")

有什么建议吗？

Answer 1

使用tidyverse包，您可以使用purrr::map_dfr函数很好地完成此purrr::map_dfr ，该函数迭代一个列表，对每次返回一个数据帧的每个元素执行一些功能，并将这些数据帧行绑定在一起。

library(readr)
library(purrr)
library(dplyr) # only used in example set up

# Setting up some example csv files to work with

mtcars_slim <- select(mtcars, 1:3)

write_csv(slice(mtcars_slim, 1:4), "mtcars_1.csv", col_names = FALSE)
write_csv(slice(mtcars_slim, 5:10), "mtcars_2.csv", col_names = FALSE)
write_csv(slice(mtcars_slim, 11:1), "mtcars_3.csv", col_names = FALSE)


# get file paths, read them all, and row-bind them all

dir(pattern = "mtcars_\\d+\\.csv") %>% 
  map_dfr(read_csv, col_names = c("mpg", "cyl", "disp"))

#> Parsed with column specification:
#> cols(
#>   mpg = col_double(),
#>   cyl = col_integer(),
#>   disp = col_integer()
#> )

#> # A tibble: 21 x 3
#>      mpg   cyl  disp
#>    <dbl> <int> <dbl>
#>  1  21.0     6 160.0
#>  2  21.0     6 160.0
#>  3  22.8     4 108.0
#>  4  21.4     6 258.0
#>  5  18.7     8 360.0
#>  6  18.1     6 225.0
#>  7  14.3     8 360.0
#>  8  24.4     4 146.7
#>  9  22.8     4 140.8
#> 10  19.2     6 167.6
#> # ... with 11 more rows

Answer 2

您可以像这样在循环本身中放入colnames

temp = list.files(pattern="*.csv")
read_csv_filename <- function(filename){
  ret <- read.csv(filename,header = F)
  ret$city <- gsub(".*[_]([^.]+)[.].*", "\\1", filename) 
  colnames(ret) <- c("Age","Gender","height","weight","city")

  ret
}

df_all <- do.call(rbind,lapply(temp,read_csv_filename))