如何为glob.glob附加路径+文件

Question

我有如下代码，它给了我一个SimpleITK错误

"ERROR: The file in the series have unsupported 3 dimensions."

打印路径的结果是

['C:/DataLuna16pred\\subset0\\1.3.6.1.4.1.14519.5.2.1.6279.6001.100225287222365663678666836860.mhd'];

如何正确使用它？

import os
import pandas as pd
import glob
import SimpleITK as sitk
import numpy as np
df = pd.read_csv("C:/DataLuna16pred/CSVFILES/candidates89.csv")
for idx in df.index:
    seriesuid=df.seriesuid[idx]
    path= 'C:/DataLuna16pred/*/'
    path = glob.glob(path+seriesuid+'.mhd')
    ds = sitk.ReadImage(path)

Answer 1

sitk.ReadImage有两个签名，第一个是sitk.ReadImage的接口，该接口使用一个字符串作为文件名。 那是为了读取单个图像。

您通过传递列表调用的第二个命令是到sitk.ImageSeriesReader，该文件采用数组或文件名列表将图像连接在一起成为一个卷。 此版本仅采用2D图像列表来形成3D图像。 您的参数path是python列表。

对我来说，不清楚您的意图是什么。 是否获得一个文件名？ 或多个？

您可能需要检查len(path)以及它是否是到sitk.ReadImage [0]的一个传递路径。