[英]Rstudio: plot a horizontal dendrogram without the labels at the same level
我想做一个层次聚类,然后在不使用标签的情况下获得水平绘图。
我的代码:
dim(bin_mat) # 53194 519
data = bin_mat[,1:10]
names(data) = seq(1:10)
mydist.jacc <- vegdist(t(data), method = "jaccard")
myhclust <- hclust(mydist.jacc,method='average')
plot(myhclust,main = "Genome Clustering")
基本上,我想要最后一个图,但要在水平图中,而标签不在同一水平。
我尝试了此命令,但标签处于同一级别。
plot(as.dendrogram(myhclust), horiz = TRUE)
由于您未提供数据集,因此我使用了“ USArrets”。 我相信您会根据以下代码了解您需要做什么。
data(USArrests)
dd <- dist(scale(USArrests), method = "euclidean")
myhclust <- as.dendrogram(hclust(dd, method = "average"))
plot(myhclust, xlab = "Height", horiz = TRUE)
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