使用 AVX-512 或 AVX-2 对大数据计算 1 位（人口计数）

Question

我有很长的内存块，比如 256 KiB 或更长。 我想计算整个块中 1 位的数量，或者换句话说：将所有字节的“人口计数”值相加。

我知道 AVX-512 有一个VPOPCNTDQ 指令，它计算 512 位向量内每个连续 64 位中 1 位的数量，而 IIANM 应该可以在每个周期发出这些指令之一（如果合适的 SIMD 向量寄存器是可用） - 但我没有任何编写 SIMD 代码的经验（我更像是一个 GPU 人）。 另外，我不是 100% 确定编译器支持 AVX-512 目标。

在大多数 CPU 上，仍然不（完全）支持 AVX-512； 但 AVX-2 是广泛可用的。 我找不到类似于 VPOPCNTDQ 的小于 512 位的向量化指令，所以即使从理论上讲，我也不确定如何使用支持 AVX-2 的 CPU 快速计算位； 也许像这样的东西存在而我只是以某种方式错过了它？

无论如何，对于两个指令集中的每一个，我都希望有一个简短的 C/C++ 函数 - 要么使用一些 intristics-wrapper 库，要么使用内联汇编。 签名是

uint64_t count_bits(void* ptr, size_t size);

笔记：

• 与如何在 Sandy Bridge 上的一系列整数中快速将位计数到单独的 bin 中有关？ ，但不是骗子。
• 如果这很重要，我们可以假设输入是对齐的。
• 忘记多个内核或套接字，我想要一个（单个线程上的）内核的代码。

Answer 1

AVX-2

@HadiBreis 的评论链接到 Wojciech Muła 的一篇关于使用 SSSE3 进行快速人口计数的文章； 文章链接到此 GitHub 存储库； 并且存储库具有以下 AVX-2 实现。 它基于矢量化查找指令，并使用 16 值查找表来获取半字节的位数。

#   include <immintrin.h>
#   include <x86intrin.h>

std::uint64_t popcnt_AVX2_lookup(const uint8_t* data, const size_t n) {

    size_t i = 0;

    const __m256i lookup = _mm256_setr_epi8(
        /* 0 */ 0, /* 1 */ 1, /* 2 */ 1, /* 3 */ 2,
        /* 4 */ 1, /* 5 */ 2, /* 6 */ 2, /* 7 */ 3,
        /* 8 */ 1, /* 9 */ 2, /* a */ 2, /* b */ 3,
        /* c */ 2, /* d */ 3, /* e */ 3, /* f */ 4,

        /* 0 */ 0, /* 1 */ 1, /* 2 */ 1, /* 3 */ 2,
        /* 4 */ 1, /* 5 */ 2, /* 6 */ 2, /* 7 */ 3,
        /* 8 */ 1, /* 9 */ 2, /* a */ 2, /* b */ 3,
        /* c */ 2, /* d */ 3, /* e */ 3, /* f */ 4
    );

    const __m256i low_mask = _mm256_set1_epi8(0x0f);

    __m256i acc = _mm256_setzero_si256();

#define ITER { \
        const __m256i vec = _mm256_loadu_si256(reinterpret_cast<const __m256i*>(data + i)); \
        const __m256i lo  = _mm256_and_si256(vec, low_mask); \
        const __m256i hi  = _mm256_and_si256(_mm256_srli_epi16(vec, 4), low_mask); \
        const __m256i popcnt1 = _mm256_shuffle_epi8(lookup, lo); \
        const __m256i popcnt2 = _mm256_shuffle_epi8(lookup, hi); \
        local = _mm256_add_epi8(local, popcnt1); \
        local = _mm256_add_epi8(local, popcnt2); \
        i += 32; \
    }

    while (i + 8*32 <= n) {
        __m256i local = _mm256_setzero_si256();
        ITER ITER ITER ITER
        ITER ITER ITER ITER
        acc = _mm256_add_epi64(acc, _mm256_sad_epu8(local, _mm256_setzero_si256()));
    }

    __m256i local = _mm256_setzero_si256();

    while (i + 32 <= n) {
        ITER;
    }

    acc = _mm256_add_epi64(acc, _mm256_sad_epu8(local, _mm256_setzero_si256()));

#undef ITER

    uint64_t result = 0;

    result += static_cast<uint64_t>(_mm256_extract_epi64(acc, 0));
    result += static_cast<uint64_t>(_mm256_extract_epi64(acc, 1));
    result += static_cast<uint64_t>(_mm256_extract_epi64(acc, 2));
    result += static_cast<uint64_t>(_mm256_extract_epi64(acc, 3));

    for (/**/; i < n; i++) {
        result += lookup8bit[data[i]];
    }

    return result;
}

AVX-512

同一个存储库还有一个基于 VPOPCNT 的 AVX-512 实现。 在列出它的代码之前，这里是简化且更易读的伪代码：

• 对于每个连续的 64 字节序列：

  • 将序列加载到 64x8 = 512 位的 SIMD 寄存器中
  • 在该寄存器上执行 8 次 64 位的并行填充计数
  • 将 8 个人口计数结果并行添加到保存 8 个和的“累加器”寄存器中

• 将累加器中的 8 个值相加

• 如果尾部少于 64 个字节，请以更简单的方式计算那里的位数

• 返回主和加上尾和

现在是真正的交易：

#   include <immintrin.h>
#   include <x86intrin.h>

uint64_t avx512_vpopcnt(const uint8_t* data, const size_t size) {
    
    const size_t chunks = size / 64;

    uint8_t* ptr = const_cast<uint8_t*>(data);
    const uint8_t* end = ptr + size;

    // count using AVX512 registers
    __m512i accumulator = _mm512_setzero_si512();
    for (size_t i=0; i < chunks; i++, ptr += 64) {
        
        // Note: a short chain of dependencies, likely unrolling will be needed.
        const __m512i v = _mm512_loadu_si512((const __m512i*)ptr);
        const __m512i p = _mm512_popcnt_epi64(v);

        accumulator = _mm512_add_epi64(accumulator, p);
    }

    // horizontal sum of a register
    uint64_t tmp[8] __attribute__((aligned(64)));
    _mm512_store_si512((__m512i*)tmp, accumulator);

    uint64_t total = 0;
    for (size_t i=0; i < 8; i++) {
        total += tmp[i];
    }

    // popcount the tail
    while (ptr + 8 < end) {
        total += _mm_popcnt_u64(*reinterpret_cast<const uint64_t*>(ptr));
        ptr += 8;
    }

    while (ptr < end) {
        total += lookup8bit[*ptr++];
    }

    return total;
}

lookup8bit是一个用于字节而不是位的 popcnt 查找表，并在此处定义。 编辑：正如评论者所指出的，在最后使用 8 位查找表不是一个好主意，可以改进。

Answer 2

除了标量清理循环之外， Wojciech Muła 的大数组 popcnt 函数看起来是最佳的。 （有关主循环的详细信息，请参阅@einpoklum 的回答）。

最后只使用几次的 256 个条目的 LUT 可能会缓存未命中，即使缓存很热，也不是超过 1 个字节的最佳选择。 我相信所有 AVX2 CPU 都有硬件popcnt ，我们可以轻松地隔离最后最多 8 个尚未计数的字节，以便为我们设置单个popcnt 。

与 SIMD 算法一样，在缓冲区的最后一个字节处进行全宽加载通常效果很好。 但与向量寄存器不同，完整整数寄存器的可变计数移位很便宜（尤其是使用 BMI2）。 Popcnt 不关心位在哪里，所以我们可以只使用移位而不需要构造一个 AND 掩码或其他什么。

// untested
// ptr points at the first byte that hasn't been counted yet
uint64_t final_bytes = reinterpret_cast<const uint64_t*>(end)[-1] >> (8*(end-ptr));
total += _mm_popcnt_u64( final_bytes );
// Careful, this could read outside a small buffer.

或者甚至更好，使用更复杂的逻辑来避免页面交叉。 例如，这可以避免页面开头的 6 字节缓冲区的页面交叉。