Rstudio 上的 SPARQL 错误

Question

我在 Rstudio 中使用 sparql 包，通过 bio2rdf 查询 OMIM。 我已经在 yasgui 中测试了我的查询并且它可以正常工作。 但是从 Rstudio 他返回以下错误：

> qde <- SPARQL(endpoint,query)
Opening and ending tag mismatch: hr line 5 and body
Opening and ending tag mismatch: body line 3 and html
Premature end of data in tag html line 1
Error: 1: Opening and ending tag mismatch: hr line 5 and body
2: Opening and ending tag mismatch: body line 3 and html
3: Premature end of data in tag html line 1

谢谢！！

Answer 1

不久前我在 RStudio 上遇到了同样的问题。 这个问题是包依赖。 您确实安装了“sparql”包及其依赖项，如下所示。

install.packages(c("SPARQL", "XML", "RCurl"))

如果您可以运行以下示例代码，那就太好了。

d <- SPARQL(url="http://statistics.data.gov.uk/sparql",
            query="SELECT * WHERE { ?s ?p ?o . } LIMIT 10",
            ns=c('time','<http://www.w3.org/2006/time#>'))
is.data.frame(d$results)
head(d$results)

我希望它对你有用。