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在GAM零膨胀泊松(ziP)模型中使用偏移量

[英]Using offset in GAM zero inflated poisson (ziP) model

我正在尝试对不同大小的森林碎片中鸟类的计数数据进行建模。 由于进行调查的地块的大小在各个片段之间也有所不同,因此我想添加调查地块的大小作为补偿项,以将计数转换为密度。

据我从本站点以前的问题中了解到,这通常是针对泊松模型完成的,因为它们具有日志链接。 我与家庭ziP一起运行的GAM模型(mgcv软件包)具有link =“ identity”。 据我了解,在这种情况下,将从响应中减去偏移项,而不是得到所需的响应/偏移率。

但是,当我使用偏移项运行模型并绘制结果图时,它似乎正在提供我想要的结果(我将泊松模型的图与ziP模型进行了比较)。

这是我使用的模型,其中Guild反映了不同的进食行会,logArea是片段大小的对数,Study是我的随机效应(数据来自多个研究)。

gam1 <- gam(Count ~ Guild + s(logArea, by=Guild) + s(Study,bs="re"), offset=lnTotalPlotsize, family=ziP(),data=Data_ommited2)

有人可以解释一下GAM在这种情况下(带有身份链接的ziP模型)如何处理偏移项吗? 是真的导致期望的响应/偏移率,还是在做其他事情?

谢谢你的帮助!

问候,罗伯特

虽然只提供了身份链接,但线性预测器返回预期计数的对数。 因此,线性预测变量在对数刻度上,您可以使用偏移量。

基本上,模型是针对日志响应而不是响应进行参数化的,因此使用了身份链接功能。 这与ziplss()系列相同。

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