R版本3.5.0 Windows For Loop读取csv无法正确读取文件

Question

我有一个文件夹（specdata），其中包含大量的csv文件。 当我运行函数以读取单个文件时，我没有问题。 但是，当我添加一个For循环以便该函数可以使用Function（1:10）文件名时，它不会识别出有10个文件。

pollutantmean <- function(directory = "specdata", pollutant = "sulfate", id = 
"001") {
pollutantcount <- 0
pollutantsum <- 0

filetype <- ".csv"
pathswitch <- "."


file_len <- nchar(id)
if (file_len == 1) {
new_id <- paste("00", id, filetype, sep = "")}
else if (file_len == 2) {
new_id <- paste("0", id, filetype, sep = "")}
else
new_id <- paste(id, filetype, sep = "")
new_path <-  file.path(pathswitch,directory, new_id)
new_data <- read.csv(new_path)
pollutantsum <- pollutantsum + sum(new_data[,pollutant], na.rm=TRUE)
pollutantcount <- pollutantcount + length(na.exclude(new_data[,pollutant])) 
meanofpollutant <- (pollutantsum / pollutantcount) 
print(meanofpollutant)

}

我应该指定上面编写的代码，以识别是否在arg中将文件ID 001.csv输入为1或01，它将写入正确的文件名以供读取。

我已经搜索了几个小时，但无法得到一个示例，该示例使我理解For循环如何清楚地读取csv文件名。 如果有人可以提出修改建议，我将不胜感激。 谢谢！

Answer 1

这是使用for循环的解决方案。

files <- list.files(path = "specdata", pattern = ".csv$")
# Since you build this up you first need a starting value
pollutantsum <- 0
pollutantcount <- 0
# Use the files argument as the 'seq' argument
for (file in files) {
  new_data <- read.csv(file)
  pollutantsum <- pollutantsum + sum(new_data[,pollutant], na.rm=TRUE)
  pollutantcount <- pollutantcount + length(na.exclude(new_data[,pollutant])) 
  meanofpollutant <- (pollutantsum / pollutantcount)
}

这是一种低效的一个典型的例子for循环，虽然你慢慢建立pollutantsum和pollutantcount，迫使R键数据走动在循环的每次迭代。

一种更有效的方法是使用lapply()读取文件，然后对列表对象执行操作。 大致来说，您将如何完成该任务：

files <- list.files(path = "specdata", pattern = ".csv$")
files.list <- lapply(files, read.csv)
pollutantsum <- sum(sapply(files.list, function(x) sum(x[, pollutant], na.rm = TRUE)))
pollutantsum <- sum(sapply(files.list, function(x) length(na.exclude(x[,pollutant]))))
meanofpollutant <- (pollutantsum / pollutantcount)

请注意，由于您未提供示例数据，因此我无法对其进行测试。