RMySQL在Fedora 28上安装错误

Question

我已经在Fedora 28，Rstudio版本1.1.4，问答中看到此RMySQL安装错误，但我没有这个问题。

我正在使用安装MySQL

R CMD安装/home/Trina/Downloads/RMySQL_0.10.14.tar.gz

我得到：

• 安装到库'/home/Trina/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5'
  • 安装源软件包“ RMySQL” ... **软件包“ RMySQL”已成功解压，并检查了MD5的总和。找到mysql_config cflags和libs！ 使用PKG_CFLAGS = -I / usr / include / mysql -m64使用PKG_LIBS = -L / usr / lib64 / mysql -lmysqlclient -lpthread -lm -lrt -lssl -lcrypto -ldl ** libs rm -f RMySQL.so RMySQL-init .o connection.o db-apply.o driver.o exception.ofields.o result.o utils.o gcc -m64 -I“ / usr / include / R” -DNDEBUG -I / usr / include / mysql -m64 -I / usr / local / include -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Werror = format-security -Wp，-D_FORTIFY_SOURCE = 2 -Wp，-D_GLIBCXX_ASSERTIONS -fexceptions -fstack-protector-strong-grecord-gcc-switches -specs = / usr / lib / rpm / redhat / redhat-hardened-cc1 -specs = / usr / lib / rpm / redhat / redhat-annobin-cc1 -m64 -mtune = generic -fasynchronous-unwind-tables -fstack-clash -保护-fcf-保护-c RMySQL-init.c -o RMySQL-init.o gcc -m64 -I“ / usr / include / R” -DNDEBUG -I / usr / include / mysql -m64 -I / usr /本地/包括-fpic -O2 -g -pipe -Wall -Werror = format-security -Wp，-D_FORTIFY_SOURCE = 2 -Wp，-D_GLIBCXX_ASSERTIONS -fexceptions -fstack-protector-strong-grecord-gcc-switches -specs = / usr / lib / rpm / redhat / redhat-hardened-cc1 -specs = / usr / lib / rpm / redhat / redhat-annobin-cc1 -m64 -mtune = generic -fasynchronous-unwind-tables -fstack-clash-protection -fcf-protection -c connection.c -o connection.o connection.c：在功能中'RS_MySQL_moreResultSets'：connection.c：224：3：错误：未知类型名称'my_bool'; 你是说“布尔”吗？ my_bool tmp; ^ ~~~~~~ bool make：*** [/ usr / lib64 / R / etc / Makeconf：159：connection.o]错误1错误：软件包“ RMySQL”的编译失败
  • 删除'/home/Trina/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/RMySQL'

我在Rstudio中使用install.packages遇到相同的问题。 感谢社区的任何帮助。

Answer 1

此错误与Linux中安装的mysql> = 8.0有关。

按照下面的mysql网站，从MySQL 8.0开始，将my_bool类型替换为bool或int C类型。

（在下面的URL中使用Ctl + F并搜索my_bool关键字可直接进入更新）

https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/zh-CN/c-api-data-structures.html

解决问题的解决方法

解压缩RMySQL tar文件，并在src文件夹下查找connection.c文件。

在connection.c文件中，只需将my_bool替换为bool类型。 然后，tar已修改了connection.c文件的RMySQL文件夹，并使用此更新的RMySQL tar文件通过R CMD INSTALL安装。

请尝试上述方法，让我知道它是否可以解决问题。