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如何计算R中消耗水平可变的滚动总和?

[英]How do I calculate a rolling sum with variable levels of depletion in R?

我正在尝试使用R来衡量一个人在补充笔芯时手头已有多少天的处方,同时考虑到所有以前的处方。 例如,如果我有这张桌子...

  member rx_id  fill_date    to_date days_supply
1      A     1 2018-10-01 2018-10-02           2
2      B     1 2016-11-07 2016-11-10           4
3      B     2 2016-11-07 2016-12-04          28
4      B     3 2016-11-08 2016-11-09           2
5      B     4 2016-11-10 2016-12-03          24

我希望以下输出

  member rx_id  fill_date    to_date days_supply_on_hand
1      A     1 2018-10-01 2018-10-02                   0
2      B     1 2016-11-07 2016-11-10                   0
3      B     2 2016-11-07 2016-12-04                   4
4      B     3 2016-11-08 2016-11-09                  30
5      B     4 2016-11-10 2016-12-03                  26

对于成员B,当第二个脚本与第一个脚本在同一天填写时,该个人手头上已经有4天的RX价值。 填写第三个脚本后,该人距离第一个脚本还有3天,而第二个脚本还有27天(总共30天)。 填写完第四个脚本后,第三个脚本将用完,但是第一个脚本还有1天,第三个脚本还有25天(总共26天)。

我知道如何在dplyr和data.table中进行滚动总计,但是我无法弄清楚如何根据以前的记录(逐个记录)来考虑可变的消耗水平。 下面是重新制作原始表的代码,在此先感谢您的任何建议!

structure(list(member = structure(c(1L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = 
c("A", 
"B"), class = "factor"), rx_id = c(1, 1, 2, 3, 4), fill_date = 
structure(c(17805, 
17112, 17112, 17113, 17115), class = "Date"), to_date = 
structure(c(17806, 
17115, 17139, 17114, 17138), class = "Date"), days_supply = c(2, 
4, 28, 2, 24)), .Names = c("member", "rx_id", "fill_date", 
"to_date", 
"days_supply"), row.names = c(NA, -5L), class = "data.frame")
library(data.table)
dt = as.data.table(your_df) # or setDT to convert in place

# merge on relevant days, then compute sum of supply - days elapsed
dt[dt, on = .(member, fill_date <= fill_date, to_date >= fill_date, rx_id < rx_id), by = .EACHI,
   sum(days_supply, na.rm = T) - sum(i.fill_date - x.fill_date, na.rm = T)]
#   member  fill_date    to_date rx_id      V1
#1:      A 2018-10-01 2018-10-01     1  0 days
#2:      B 2016-11-07 2016-11-07     1  0 days
#3:      B 2016-11-07 2016-11-07     2  4 days
#4:      B 2016-11-08 2016-11-08     3 30 days
#5:      B 2016-11-10 2016-11-10     4 26 days

使用一个简单的循环

dt$days_supply_on_hand <- 0
for (a in unique(dt$member)) {
  I <- which(.subset2(dt,1) == a)
  flDate <- as.integer(.subset2(dt,3)[I])
  toDate <- as.integer(.subset2(dt,4)[I])
  V <- vapply(seq_along(I), function (k) sum(toDate[1:(k-1)] - flDate[k] + 1), numeric(1))
  dt$days_supply_on_hand[I] <- c(0,V[-1])
}
dt
  member rx_id  fill_date    to_date days_supply days_supply_on_hand
1      A     1 2018-10-01 2018-10-02           2                   0
2      B     1 2016-11-07 2016-11-10           4                   0
3      B     2 2016-11-07 2016-12-04          28                   4
4      B     3 2016-11-08 2016-11-09           2                  30
5      B     4 2016-11-10 2016-12-03          24                  26

其中dt是上面提供的数据帧。 (请注意,使用.subset2as.integer出于效率目的-可以更改它们以提高可读性)。

暂无
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