无法在Linux CentOS 7上安装R oligo和RCurl软件包

Question

我试图在装有Linux CentOS 7的笔记本电脑上安装Bioconductor oligo R软件包。它无法通过常见的Bioconductor安装命令进行安装，因为它说RCurl是为注释Rversion安装的，需要重新安装。

我试图通过以下命令安装它： install.packages("RCurl")但是不幸的是它没有用。

这是日志：

Error: package or namespace load failed for ‘RCurl’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/home/davide/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/RCurl/libs/RCurl.so':
  libiconv.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: loading failed

Execution halted ERROR: loading failed
* removing ‘/home/davide/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/RCurl’

The downloaded source packages are in   ‘/tmp/RtmpAcmmPE/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("RCurl") :   installation of package ‘RCurl’ had non-zero exit status

关于如何使其工作的任何想法？

Answer 1

通过安装miniconda并使用其R版本，我能够在R中安装RCurl和oligo软件包。

这是我所做的：

1. 我从他们的网站下载了miniconda安装程序（我的案例是64位（bash安装程序） ）

2. 我使该文件可执行，然后执行它。 在shell终端上，我运行了：
   chmod 777 ./Downloads/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

   ./Downloads/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

3. 我回答miniconda提示我的所有问题。
4. 安装miniconda后，我运行了R： R
5. 然后，我重新安装了RCurl： install.packages("RCurl");

6. 然后我安装了oligo：

   if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))

   install.packages("BiocManager")

   BiocManager::install("oligo", version = "3.8")

这样，一切对我来说都很好。 我希望它可以帮助其他人！