生成igraph中每个顶点的边缘权重列表

Question

igraph函数：

nn.list <- adjacent_vertices(g, V(g))

输出每个顶点的相邻顶点列表。

这是非常有用的。 但是现在我需要包含边缘权重的类似列表。

例如，如果顶点600具有遵循相邻顶点597, 598, 599, 601从找到的nn.list[[600]]我现在需要一个列表，其中条目600给出顶点之间的边的权值600与每个邻近顶点的597, 598, 599, 601 。

我可以使用for循环执行此操作-但速度很慢。 我的网络大约有10^4节点和10^5边缘。 我正在寻找一种矢量化方法。 igraph是否有内置函数可以帮助我做到这一点？ 有什么建议么？

Answer 1

library(igraph)
g<-make_empty_graph(directed = F)

g<-add.vertices(g,c(10))

g<-add_edges(g,c(3,5))
g<-add_edges(g,c(4,5))
g<-set_edge_attr(graph = g,name="weight",index = E(g)[1],value = 0.3)
g<-set_edge_attr(graph = g,name="weight",index = E(g)[2],value = 10)


gedges<-E(g)
gweights <- E(g)$weight

as_adj(g)


 as_adj(g,attr="weight")

as_adj(g)
as_adj(g,attr="weight")
as_adj(g,attr="weight", edges = T,sparse = F)

如果要检索所有边的向量，请使用E(g) ，如果要获取所有权重的向量，请使用E(g)$weight

然后，由于您似乎需要一个adjacency matrix ，可以使用as_adj调整参数，直到获得所需的所有信息！