使用ggplot可视化因子水平之间的差异

Question

我想创建一个情节，但我不知道如何成功实现此目标。

我有2个数据框，一个包含每个因子水平的平均值，另一个包含这些水平之间的成对差异。

contrasts <- data.frame(Level1 = c("setosa", "setosa", "versicolor"),
                        Level2 = c("versicolor", "virginica", "virginica"),
                        Diff = c(0.65, 0.46, -0.20),
                        CI_low = c(0.53, 0.35, -0.32),
                        CI_high = c(0.75, 0.56, -0.09))

means <- data.frame(Species = c("setosa", "versicolor", "virginica"),
                    Mean = c(3.42, .77, 2.97))

我的目标是使用均值作为三角形的起点，该三角形将“投影”到相应对比度的水平上，该高度等于CI（ CI_low和CI_high ）。 这样看起来就像是（请原谅我的画）：

使用以下内容，我轻松添加了初始要点：

library(tidyverse)

means %>%
  ggplot() + 
  geom_point(aes(x = Species, y= Mean)) + 
  geom_ribbon(data=contrasts, aes(x=Level1, ymin=CI_low, ymax=CI_high))

但是我很难添加三角形。 有任何想法吗？ 非常感谢！

编辑

感谢Yuriy Barvinchenko，它提供了获得此代码的代码：

contrasts %>% 
  bind_cols(id=1:3) %>% 
  inner_join(means, by=c('Level1' = 'Species')) %>% 
  select(id, x=Level1, y=Mean) %>% 
  bind_rows( (contrasts %>% 
                bind_cols(id=1:3) %>% 
                select(id, x=Level2, y=CI_low)),
             (contrasts %>% 
                bind_cols(id=1:3) %>% 
                select(id, x=Level2, y=CI_high))) %>% 
  ggplot(aes(x = x, y= y, group=id)) + 
  geom_polygon()

但是，基于这种方法，我希望中间级别（杂色）是“最低”的，而在该图中，维吉尼亚是最低的。

Answer 1

如果我正确理解您的问题，则需要这样的代码：

contrasts <- tibble(Level1 = c("setosa", "setosa", "versicolor"),
                        Level2 = c("versicolor", "virginica", "virginica"),
                        Diff = c(0.65, 0.46, -0.20),
                        CI_low = c(0.53, 0.35, -0.32),
                        CI_high = c(0.75, 0.56, -0.09))

means <- tibble(Species = c("setosa", "versicolor", "virginica"),
                                            Mean = c(3.42, .77, 2.97))

library(tidyverse)

contrasts %>% 
  bind_cols(id=1:3) %>% 
  inner_join(means, by=c('Level1' = 'Species')) %>% 
  select(id, x=Level1, y=Mean) %>% 
  bind_rows( (contrasts %>% 
                bind_cols(id=1:3) %>% 
                select(id, x=Level2, y=CI_low)),
             (contrasts %>% 
                bind_cols(id=1:3) %>% 
                select(id, x=Level2, y=CI_high))) %>% 
  ggplot(aes(x = x, y= y, group=id)) + 
  geom_polygon()

请注意，为了避免因素，我使用tibble()代替了data.frame() ，以便更轻松地连接这些表。