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如何用sed命令替换特定字符的字符串

[英]How to replace a string of specific characters with sed command

我想使用sed命令删除一些特定的字符串。

这是文件(tRNA.fa):

>tRNA-Ala-AGC-1-1 (chrII.trna5-AlaAGC) chrII:4565386-4565457 (+) Ala (AGC) 72 bp Sc: 72.4
GGGGGTATAGCTCAGTGGTAGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGgCTGGGGTTCAATTC
CCCATACCTCCA
>tRNA-Ala-AGC-1-10 (chrX.trna261-AlaAGC) chrX:7378738-7378809 (-) Ala (AGC) 72 bp Sc: 72.4
GGGGGTATAGCTCAGTGGTAGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGgCTGGGGTTCAATTC
CCCATACCTCCA
>tRNA-Ala-AGC-1-11 (chrX.trna260-AlaAGC) chrX:7507245-7507316 (-) Ala (AGC) 72 bp Sc: 72.4
GGGGGTATAGCTCAGTGGTAGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGgCTGGGGTTCAATTC
CCCATACCTCCA

我只想保留“> tRNA-XXX-XXX-XX”和下一行。

所以,我试图用sed命令替换不必要的信息:

sed -i 's/\(.*\).*[0-9]$//g' tRNA.fa

但是,我删除了所有以“>”开头的行。

我希望得到的结果是:

>tRNA-Ala-AGC-1-1 
GGGGGTATAGCTCAGTGGTAGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGgCTGGGGTTCAATTC
CCCATACCTCCA
>tRNA-Ala-AGC-1-10 
GGGGGTATAGCTCAGTGGTAGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGgCTGGGGTTCAATTC
CCCATACCTCCA
>tRNA-Ala-AGC-1-11 
GGGGGTATAGCTCAGTGGTAGAGCGCTCCCTTAGCATGGGAGAGGgCTGGGGTTCAATTC
CCCATACCTCCA

如果您知道如何更换它,请告诉我,谢谢。

如果要匹配(请不要转义。

sed -i 's/(.*).*[0-9]$//g' tRNA.fa

但实际上以下内容足以删除( :之后的所有内容

sed -i 's/(.*//' tRNA.fa

请注意,您可能还需要s/ (.*//之前删除空间(太。

\\(...\\)用于将表达式分组为一个子组。 它最常用于反向引用,但也可以用作\\(abc\\)* -将搜索零个或多个出现的字符串"abc"

是一个很棒的sed简介。

暂无
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