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对数据框内的两组列应用条件

[英]apply conditional on two groups of columns within dataframe

我有一个df:

a<-c(5,1,5,3,5,3,5,1)
b<-c(1,5,1,5,1,5,3,5)

df<-as.data.frame(rbind(a,b))
names(df)<-c('pre1','post1','pre2','post2','pre3','post3','pre4','post4')

我在列中有两组样本,例如“ pre”和“ post”:

pre<-seq(1,8,by=2)
post<-seq(2,8,by=2)

我想应用一个条件,即合格前的100%和职务后的50%或合格前的50%和职务的100%

例如

如果'pre'的100%为3或以上,且50%的post为3或以上,则保留行,或者如果'pre'的50%为3或以上,且100%的post为3或以上,则保留行,因此在示例df中仅此行“ a”会留下

我有:

test<- ((df[apply(df[pre],1,function(x) sum(x>=3)/length(x)),] & 
         df[apply(df[post],1,function(x) sum(x>3)/length(x))>=0.5,]) | 
        (df[apply(df[pre],1,function(x) sum(x>3)/length(x))>=0.5,] & 
         df[apply(df[post],1,function(x) sum(x>3)/length(x)),]))

但是我得到了一个“ TRUE”的向量,这不是我想要的。

我们可以创建一个逻辑向量以使用rowSums进行比较

df[(rowSums(df[pre] >= 3)/length(pre) == 1) & 
    (rowSums(df[post] >= 3)/length(post) >= 0.5) |
    (rowSums(df[post] >= 3)/length(post) == 1) & 
    (rowSums(df[pre] >= 3)/length(pre) >= 0.5), ]

#  pre1 post1 pre2 post2 pre3 post3 pre4 post4
#a    5     1    5     3    5     3    5     1

使用apply我们可以做到

df[apply(df[pre] >= 3, 1, all) & apply(df[post] >= 3, 1, sum)/length(post) >= 0.5 |
   apply(df[post] >= 3, 1, all) & apply(df[pre] >= 3, 1, sum)/length(pre) >= 0.5, ]

这是一个不太简洁的tidyverse解决方案,可能会大大缩短。

library(tidyverse)
pass_val = 3
df %>%
  rownames_to_column() %>%
  gather(col, val, -rowname) %>%
  separate("col", c("type", "num"), sep = -1) %>%
  count(rowname, type, pass = val >= pass_val) %>%
  spread(pass, n, fill = 0) %>%
  transmute(rowname, type, pass_pct = `TRUE`/(`TRUE` + `FALSE`)) %>%
  spread(type, pass_pct) %>%
  filter(post == 1 & pre >= 0.5 | post >= 0.5 & pre == 1)

这是tidyverse一种选择

library(tidyverse)
library(rap)
crossing(val = c(0.5, 1), cols = c("pre", "post")) %>%
   rap(x = ~ df %>% 
                 select(matches(cols)) %>%
                 {rowMeans(. >=3) >= val}) %>%
                 group_by(val) %>% 
                 transmute(ind = reduce(x, `&`)) %>% 
                 filter(any(ind)) %>% 
                 pull(ind) %>% 
   filter(df, .)
#  pre1 post1 pre2 post2 pre3 post3 pre4 post4
#1    5     1    5     3    5     3    5     1

这是一个基本的R解决方案,它按行名称进行sapply ,使用sapply检查条件,并将输出用作df上的逻辑索引:

df[sapply(split(df, rownames(df)), function(x) {
    (sum(x[pre] > 2)/ncol(x[pre]) >= .5) & (sum(x[post] > 2)/ncol(x[post]) == 1) ||
    (sum(x[pre] > 2)/ncol(x[pre]) == 1) & (sum(x[post] > 2)/ncol(x[post]) >= .5)
}),]

#### OUTPUT ####

  pre1 post1 pre2 post2 pre3 post3 pre4 post4
a    5     1    5     3    5     3    5     1

暂无
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