[英]IndexError: string index out of range, error in function
我在jupyter笔记本上的python中完成了一些代码,以分析基因序列列表。 当我运行时,它将打印两个输入字符串a
和b
的长度。 然后给我一个错误。
下面提供了功能和错误。
def hamming_distance(string1, string2):
distance = 1
L = len(string1)
for i in range(L):
if string1[i] != string2[i]:
distance += 1
return distance
'len a=', 123, ' lenb b', 122)
---------------------------------------------------------------------------
IndexError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-34-c459e7a881a4> in <module>()
2 b= Sequences.index[1]
3 print('len a=', len(a), ' lenb b', len(b))
----> 4 hamming_distance(a, b)
<ipython-input-24-c7ce8bb7c40a> in hamming_distance(string1, string2)
9 for i in range(L):
10 # Add 1 to the distance if these two characters are not equal
---> 11 if string1[i] != string2[i]:
12 distance += 1
13 # Return the final count of differences
IndexError: string index out of range
您的string2
比string1
短至少一个字符。 假设您有
string1 = "Hollow"
string2 = "Hello"
然后,当i == 5
,您最终会寻找
string1[5] --> "w"
string2[5] --> IndexError
为了避免这种情况的发生,您可以将L
在较短的字符串的长度上 ,如下所示:
L = min(len(string1), len(string2))
或针对长度不匹配的情况提出特殊情况(默认情况下,“汉明距离”假设字符串长度相同。如果要比较不同长度的字符串,则可能需要考虑使用Levenshtein距离,而是一个python模块 )。
如果string2小于string1,则代码中存在问题。 如果真是这样,您将最终尝试比较string2中不存在的string1中更高位置的字符。
我不确定这是否是解决此问题的正确方法,但是您可以将L定义为:
L = min(len(string1), len(string2))
这将比较尽可能多的字符,直到您到达字符串之一的末尾。
您的示例数据肯定会出现此问题。 您将比较两个字符串中的122个字符,但是对于最后一个字符,将得到此错误,因为string2中的位置122处没有字符(字符串中的第123个字符)。
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