将 conda 包安装到 google colab

Question

我尝试将软件包从 anaconda 安装到 google 的 colab。

但它不起作用。 整个事情都是巫毒魔法。

以下代码位于一个单元格中。

笔记本的单元格：

!wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
!bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -f -p /usr/local/
!rm Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
!conda install -y --prefix /usr/local/ ujson aiohttp tqdm
import sys
os.environ['PYTHONPATH'] = "/usr/local/miniconda3"
os.environ['PATH'] = '/usr/local/miniconda3/bin:' + os.environ['PATH']
sys.path.append('/usr/local/lib/python3.6/site-packages/')
import ujson

结果：

ModuleNotFoundError: No module named 'ujson'

如果我使用“！bash”进入 bash shell，然后运行“bash 的”python，我可以在该 python 中导入 ujson。 但是，如果我直接在“笔记本”python 中导入 ujson，则不起作用。

这里的方法似乎不再有效

• 如何通过 colab.research 上的 conda 构建库？
• 与 Google Colab 兼容的最新 conda 版本是什么，建议如下，但现在不起作用：

!wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh
!chmod +x Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh
!bash ./Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh -b -f -p /usr/local
!conda install -q -y --prefix /usr/local ujson
import sys
sys.path.append("/usr/local/conda/lib/python3.6/site-packages/")
print(ujson.dumps({1:2}))

最新的 hack 是什么？

Answer 1

有2个问题必须解决：

• ujson 通常会升级到 python 3.7，必须避免这种情况。
• conda 库的路径已更改，必须更新它。

对于 1，您需要将python=3.6添加到conda install 。

对于2，您需要将路径添加到/usr/local/lib/python3.6/site-packages

这是新代码

# same
!wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh
!chmod +x Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh
!bash ./Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh -b -f -p /usr/local
# update 1
!conda install -q -y --prefix /usr/local python=3.6 ujson
# update 2
import sys
sys.path.append('/usr/local/lib/python3.6/site-packages')
# test it
import ujson
print(ujson.dumps({1:2}))

Answer 2

在 google colab Jupyter IDE 中，尝试执行：

!pip install ujson

这以前对我有用。 让我知道它现在是否有效。

Answer 3

#如果有人想使用google collab实现，只需在编译其他单元格之前运行它

!wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py37_4.8.2-Linux-x86_64.sh

!chmod +x Miniconda3-py37_4.8.2-Linux-x86_64.sh

!bash ./Miniconda3-py37_4.8.2-Linux-x86_64.sh -b -f -p /usr/local 导入系统

sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages/'