Plotly：如何在箱线图上添加中线

Question

我想在我的箱线图上添加一条中线的痕迹。

像这样

到目前为止，这是我的情节：

library(plotly)
p <- plot_ly(y = ~rnorm(50), type = "box") %>%
  add_trace(y = ~rnorm(50, 1))

p

Answer 1

只需从使用plot_ly(..., type='scatter', mode='lines', ...) ，然后使用add_boxplot(...' inherit=FALSE, ...)每个箱线图。 以下是对整个data.frame执行此操作的方法：

带有示例数据的完整代码：

library(dplyr)
library(plotly)

# data
df <- data.frame(iris) %>% select(-c('Species'))
medians <- apply(df,2,median)

# create common x-axis values for median line and boxplots
xVals <- seq(0, length(medians)-1, by=1)

# plotly median line setup
p <- plot_ly(x = xVals, y=medians, type='scatter', mode='lines', name='medians')

# add a trace per box plot
i <- 0
for(col in names(df)){
  p <- p %>% add_boxplot(y = df[[col]], inherit = FALSE, name = col)
  i <- i + 1
}

# manage layout
p <- p %>% layout(xaxis = list(range = c(min(xVals)-1, max(xVals)+1)))
p

Answer 2

另一种选择是使用 ggplot2 并将其转换为 plotly

library(ggplot2)
library(dplyr)
library(tidyr)
library(plotly)

p = iris %>% pivot_longer(-Species) %>%
 ggplot(aes(x=name,y=value,col=name)) + 
geom_boxplot() + stat_summary(inherit.aes = FALSE,
aes(x=name,y=value,group=1),fun.y=median,geom="line")
ggplotly(p)

代码的简要说明，我使用pivot_longer的tidyr将数据框转换为长格式，并首先制作了列名作为x变量和颜色的箱线图。

stat_summary部分，我再次指定了相同的 x 和 y 变量，这次省略了颜色，添加了group=1 ，这告诉stat_summary将整个数据框视为一组，并汇总每个 x 的所有 y 值-组，并通过它画一条线。