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检查 R 中缺失数据模式的最优雅方法是什么?

[英]what is the most elegant way to check for patterns of missing data in R?

我在 R 中有一组数字向量,每个长度为 16。我想选择那些所有值都存在于以下四个位置之一的向量:1:4, 5:8, 9:12, 13:16

例如向量c(NA, 1, NA, 1, 1, 1, 1, 1, NA, NA, 1, NA, NA, 1, NA, 1, NA)将通过测试,因为位置 5:8 都是非 NA。

测试这个的最优雅(即使用最少的易于阅读的代码)方法是什么?

使用索引列表,您可以遍历这些范围并查找没有任何NA

vec <- c(NA, 1, NA, 1, 1, 1, 1, 1, NA, NA, 1, NA, NA, 1, NA, 1, NA)
sapply(list(1:4, 5:8, 9:12, 13:16),
       function(ind) !anyNA(vec[ind]))
# [1] FALSE  TRUE FALSE FALSE

如果要返回这些索引中的值:

inds <- list(1:4, 5:8, 9:12, 13:16)
good <- sapply(inds, function(ind) !anyNA(vec[ind]))
# should check that `any(good)` is true
inds[[ which(good)[1] ]]
# [1] 5 6 7 8
vec[ inds[[ which(good)[1] ]] ]
# [1] 1 1 1 1

这是一个带有rleid的选项,用于获取向量的运行长度编码 ID,将其用作分组变量以检查是否有任何序列具有完整的非 NA 元素集

library(data.table)
any(as.logical(ave(seq_along(v1) * v1, rleid(v1),
         FUN = function(x) all(!is.na(x))) ))
#[1] TRUE

或者它也可以

any(with(rle(!is.na(v1)), lengths[values] >=4))
#[1] TRUE

或者另一种选择是table

4 %in% table(v1 * (seq_along(v1) -1) %/% 4)
#[1] TRUE

数据

v1 <- c(NA, 1, NA, 1, 1, 1, 1, 1, NA, NA, 1, NA, NA, 1, NA, 1, NA)

以下代码将返回单个值( TRUEFALSE )。 如果向量通过测试,则返回TRUE

vec <- c(NA, 1, NA, 1, 1, 1, 1, 1, NA, NA, 1, NA, NA, 1, NA, 1, NA)

!all(tapply(vec, rep(1:length(vec), each = 4, len = length(vec)), anyNA))
# [1] TRUE

暂无
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