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python.networkx 有向图中的单独边箭头

[英]Separate edge arrows in python/networkx directed graph

我想获得类似这样的东西:

在此处输入图像描述

使用 python 库networkx 我可以使用以下代码生成类似的有向图:

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

G = nx.DiGraph()

G.add_edge('1','2')
G.add_edge('1','3')
G.add_edge('3','2')
G.add_edge('3','4')
G.add_edge('4','3')

nx.draw(G, node_color='w', edgecolors='k', width=2.0, with_labels=True)
plt.show()

产生:

在此处输入图像描述

但是,节点 3 和 4 之间的箭头是叠加的,看起来只是一个有两个头的箭头。 是否可以将它们稍微分开,以便更清楚地表明那里有两条边,而不仅仅是一条边? (我知道可以使用 pygraphviz 来完成,但我正在尝试使用 matplotlib 来完成)。

您需要一个MultiDiGraph用于两个节点之间的多条边:

G = nx.MultiDiGraph()

G.add_edge('1','2')
G.add_edge('1','3')
G.add_edge('3','2')
G.add_edge('3','4')
G.add_edge('4','3')

要可视化网络,您可以使用显示平行边的 Graphviz。 您可以在dot中编写图形并使用graphviz.Source显示图形:

from networkx.drawing import nx_pydot
from graphviz import Source

nx_pydot.write_dot(G, 'multig.dot')
Source.from_file('multig.dot')

在此处输入图像描述

我前段时间 fork 了 .networkx 绘图实用程序来解决这个问题和我遇到的其他几个问题。 package 称为netgraph ,支持绘制networkxigraph图结构(以及简单的边列表)。 它在引擎盖下使用 matplotlib,并公开创建的艺术家,以便即使没有内置功能也可以轻松地进一步操作它们。

#!/usr/bin/env python

"""
https://stackoverflow.com/questions/61412323/separate-edge-arrows-in-python-networkx-directed-graph
"""

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
import netgraph

G = nx.DiGraph()

G.add_edge('1','2')
G.add_edge('1','3')
G.add_edge('3','2')
G.add_edge('3','4')
G.add_edge('4','3')

netgraph.draw(G, node_color='w', edge_color='k', edge_width=2.0, node_labels={str(ii) : str(ii) for ii in range(1,5)})
plt.show()

在此处输入图像描述

暂无
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