bash 循环读取 txt 文件中的变量并对其进行处理

Question

大家好，星期六好，

我有一个看起来像这样的文本文件

 OTU    sample  Idfolder    linkGenome
TM7_phylum_sp._oral_taxon_488   6405    T1  ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/005/697/215/GCF_005697215.1_ASM569721v1/GCF_005697215.1_ASM569721v1_genomic.fna.gz
TM7_phylum_sp._oral_taxon_957   6405    T2  ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/005/697/565/GCF_005697565.1_ASM569756v1/GCF_005697565.1_ASM569756v1_genomic.fna.gz
Streptococcus_cristatus 6405    SC  https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/385/925/GCF_000385925.1_ASM38592v1/GCF_000385925.1_ASM38592v1_genomic.fna.gz

我想创建一个循环，1）读取文件并使用我文件第三列（Idfolder 列）的名称创建子文件夹； 2）进入每个文件夹并从位于同一txt文件第4列的相应链接下载文件

有人对如何执行此操作有一些建议吗？ 非常感谢A。

Answer 1

有人对如何执行此操作有一些建议吗？

我不会使用“bash 循环”来完成此操作。 我最近正在试验awk ，所以我会使用该工具和wget下载文件：

awk 'NR > 1 { system("mkdir -p " $3); system("wget -P " $3 " " $4); }' < in.txt

其中in.txt是您的 txt 文件。