如何使用 R 中的 for 循环创建多个图，每个图都有不同的 y 轴标签和标题？

Question

一些背景：我试图分析的数据是流式细胞术数据（对于那些不熟悉这是什么的人，为了这个 Q 的目的，它基本上是使用激光来表征不同的细胞类型）。 我在这里的变量是要在 y 轴上绘制的单元格的不同特征，并且每个变量都是从“父组”中读取的。 也就是说，如果感兴趣的变量是 Live Cells，则父组可以是肾细胞或肺细胞等。

我有一个包含 13 个变量的大型数据表，需要针对相同的 x 轴绘制，即治疗后的时间（以周为单位）。 我需要 plot 对时间的每个变量，需要不同的 y 轴 label 和一个标题，该标题应该包括y 轴 label 以及相应的“父组”变量的名称。 我采取的步骤是：

1. 将主数据表导入R
2. 导入带有关键字的数据表，即每个变量名称（即主数据表中的列名）以及其各自的Y轴label和“父组”名称。 举个例子，这张桌子是这样的，

在此处输入图像描述

如您所知，“父组”名称或 y 轴标签不一定对每个变量名称都是唯一的

3. 将关键字数据表的每一列分配给一个新的向量，即变量、y轴和父级。
4. 创建一个 FOR 循环以自动从原始主表中子集数据，一次包含一个变量的信息，然后按时间 plot 它。

    r 
   for(i in variables){
    table<-as.data.frame(test[,c("WEEK",i)])`
    for(j in yaxis){
    for (k in parent){
    plot<-ggplot(table,aes(x=WEEK,y=table[,3]))+geom_line()+geom_point(size=2)+scale_shape_manual(values=1:25)+xlab("Weeks")+ylab(j)+theme_minimal()+ggtitle(paste0(k,"-",j))
ggsave(plot,file=paste0(paste(j,k,sep="_"),"plot.jpg"),width=14,height=10,units="cm")
     }
      }
      rm(table)
      rm(plot)
    }

我在这里尝试做的是自动化 for 循环以添加相应的 y 轴 label 和每个变量的标题，但我当然陷入了一个循环，它继续运行并生成每个变量 13 个 y 轴的组合标签 * 13 plot 标题组合。 我需要 13 个图，每个图都有自己的 y 轴标签和 plot 标题，而无需为每个图手动输入，因为我希望将图直接从 for 循环导出为 jpeg 文件。 我考虑过使用 if 或 if else 函数，但我不确定如何在此处应用这些函数。 对此的任何帮助将不胜感激！

Answer 1

这是一种解释您的问题的方法：使用构面绘图和 map Parent级和Yaxis进入构面 label。 这将产生一系列方面 plot 其中 label 反映Parent和Yaxis 。

要进行分面，我们需要重塑数据框。 首先，调用库并创建一些有用的数据：

library(dplyr)
library(tidyr)
library(tibble)
library(ggplot2)

# make fake data
data <- tibble(
  Week = seq(from = 1, length.out = 91),
  cells_live = runif(min = 1, max = 10, n = 91),
  cells_live_dividing = runif(min = 1, max = 10, n = 91),
  cells_live_aging = runif(min = 1, max = 10, n = 91)
)

mapping <- tibble(
  variables = c("cells_live", "cells_live_dividing", "cells_live_aging"),
  Parent = c("COUNT", "live", "live"),
  Yaxis = c("live cells", "divinding cells", "aging")
)

然后我们使用来自pivot_longer的tidyr将数据重新整形为长格式：

data <- data %>%
  pivot_longer(cols = -Week,
               names_to = "vars",
               values_to = "values")

然后，我们使用Yaxis从映射表中引入数据，并使用基于Parent和left_join的构面标签创建一个新列：

data <- data %>%
  left_join(mapping, by= c("vars" = "variables")) %>%
  mutate(facet_labels = paste0(Parent, ": ", Yaxis))

最后，我们调用ggplot ，使用facet_labels作为 facetting 变量：

ggplot(data = data, aes(x = Week, y = values)) +
  geom_point() +
  facet_wrap(.~ facet_labels, scales = "free") +
  theme_minimal()

有了这个 output：

这并不完全是您所要求的，但希望它对您有用。