“装配工出错……”尝试使用 rms 库中的 lrm function

Question

我正在尝试通过 rms 库中的 lrm function 运行一个小型数据表，但每次运行它我都会得到：

Error in fitter(X, Y, offset = offs, penalty.matrix = penalty.matrix,  : 
NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

这是一些可重现的代码：

library(tidyverse)
library(rms)

data <- tribble(
~a, ~b, ~c,
"name", 2, 77.95535,
"name", 2, 81.36152,
"name", 2, 80.87081,
"name", 2, 80.59054,
"name", 2, 79.36807,
"name", 2, 82.42083,
"name", 2, 78.80646,
"name", 2, 78.88949
)

lmod <- lrm(b~c, data, penalty=0, x=T, y=T, tol=1e-10, maxit=1e6)

我尝试了各种各样的事情。 我尝试将 b~c 切换到 c~b （我知道它不会产生相同的数据）并且我得到了一个错误，但不是同样的错误。 我尝试仅使用前两个参数，以及包括或排除以下参数的各种参数。 我也尝试过调试并将代码跟踪到 lrm function 中，然后我将其范围缩小到（令人震惊的）装配工 function。

以下是我一直在使用的一些资源，您可能会发现它们对自己有帮助或对我有所帮助。 如果有什么我忘了包括发表评论，我会填写我能做的:) 谢谢！

R 参考手册

lrm Function 说明

R 用于数据科学（书籍）

lrm Function 源代码

Answer 1

使用您提供的数据，我得到了同样的错误。 然后我将一些b更改为 1，错误消失了：

data <- tribble(
  ~a, ~b, ~c,
  "name", 2, 77.95535,
  "name", 2, 81.36152,
  "name", 1, 80.87081,
  "name", 1, 80.59054,
  "name", 2, 79.36807,
  "name", 1, 82.42083,
  "name", 1, 78.80646,
  "name", 2, 78.88949
)

lmod <- lrm(b~c, data = data, penalty=0, x=TRUE, y=TRUE, tol=1e-14, maxit=1e10)
lmod

Logistic Regression Model

 lrm(formula = b ~ c, data = data, x = TRUE, y = TRUE, penalty = 0, 
     tol = 1e-14, maxit = 1e+10)

                   Model Likelihood    Discrimination    Rank Discrim.    
                         Ratio Test           Indexes          Indexes    
 Obs         8    LR chi2      0.00    R2       0.000    C       0.500    
  1          4    d.f.            1    g        0.000    Dxy     0.000    
  2          4    Pr(> chi2) 1.0000    gr       1.000    gamma   0.000    
 max |deriv| 3                         gp       0.000    tau-a   0.000    
                                       Brier    0.250                     

           Coef   S.E.    Wald Z Pr(>|Z|)
 Intercept 0.0000 39.9600 0.00   1.0000  
 c         0.0000  0.4992 0.00   1.0000 

我知道这只是您数据的一个子集，但也许b中的所有行都有值 2？ 您可以使用例如table(data$b)进行检查