[英]“Desired structure doesn't exist” for PDB retrieve_pdb_file method
尝试使用 Biopython 的 Bio.PDB.PDBList 从 PDB 下载一些蛋白质数据
这是一分钟。 可重现的例子:
from Bio.PDB import PDBList
pdbl=PDBList()
pdbl.retrieve_pdb_file('1GAV', file_format="pdb")
这将返回:
Downloading PDB structure '1GAV'...
Desired structure doesn't exists
期望的行为是将 PDB 文件下载到工作目录。
可能有用的信息:
我们认为问题与我们的公司 VPN 有关,因为它在 VPN 关闭时工作(尽管代理仍然打开)。 正如 sammam 所说,代码中没有问题。
不知道我们的 VPN 发生这种情况的具体原因,如果我发现会更新。
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