将 libpq.5.dylib 复制到 /usr/lib/libpq.5.dylib

Question

我无法在 R 中加载包，因为文件libpq.5.dylib不在/usr/lib/libpq.5.dylib中。 它在/usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib

我试过这条线： sudo ln -s /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib /usr/lib/libpq.5.dylib但我得到了这个响应： ln: /usr/lib/libpq.5.dylib: Operation not permitted

我该怎么做才能在/usr/lib/libpq.5.dylib中获取文件而不引起问题？ 这个解决方案表明我可能会面临问题，所以我不知道该怎么做。

Answer 1

你真的不希望它在/usr/lib中。 Apple 宣布这是禁区，并且在较新的 macOS 版本上，它存在于只读卷上。 除非您愿意进入恢复模式并手动篡改卷（并可能在未来的操作系统更新中重复），否则这不是要走的路。

相反，让我们解决核心问题：
macOS 上的动态库在二进制文件中嵌入了自己的安装路径，链接器将其复制到链接到它们的二进制文件中。 可以使用install_name_tool更改此信息（请参阅man install_name_tool ）。

1. 检查 dylib 的安装名称：

    otool -l /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib | fgrep -A2 LC_ID_DYLIB

   如果打印的路径已经指向 dylib 本身（或符号链接到它的路径），请将此路径用作下面的[new_path] ，并跳过步骤 2。

2. 如果 dylib 的安装名称不指向自身，请运行以下命令：

    sudo install_name_tool -id /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib /usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib

   并在下面的[new_path]中使用/usr/local/Cellar/libpq/13.0/lib/libpq.5.dylib 。

3. 对于链接到 dylib 的二进制文件，运行：

    sudo install_name_tool -change /usr/lib/libpq.5.dylib [new_path] [path_to_binary]

Answer 2

我在通过 docker 构建容器以供 API 使用时遇到了同样的问题：RPostgres 已安装，但库无法加载，同样的错误消息。 由于我在我的机器上安装了 Postgres，我认为问题已经解决，因此我在 local 上没有这样的消息； 但这是我在 dockerfile 中解决这个问题的方法，在没有安装 R 的机器上 100% 验证：

RUN apt-get update && apt-get install libpq5 -y

因此，在您的终端上执行apt-get update && apt-get install libpq5 -y应该可以解决问题。 轻便高效。