在linux中，将多个目录中的同名文件复制到一个以路径不同为名称的新目录中

Question

我在需要整理和分析的子目录中有几百个输出患者文件。

/project/folder1/folder2/samplenumber/file.filetype

我需要将所有这些从托管区域复制到我自己的工作区进行分析

我想结束

/mydrive/myproject/myfolder/samplenumber.filetype
/mydrive/myproject/myfolder/samplenumber.filetype
/mydrive/myproject/myfolder/samplenumber.filetype

我想像

cp -v /project/folder1/folder2/*/file.filetype /mydrive/myproject/myfolder/*.filetype

会有这个功能吗？

Answer 1

您将需要为此使用 find 命令，在循环中解析输出

find /project/folder1/folder2 -name "*.filetype" | while read line
do 
    payth=${line%/*.*}
    samp=${payth#/*/*/*/}
    cp "$line" "/mydrive/myproject/myfolder/$samp.filetype"
done

对于 find 命令返回的每一行，我们将变量 payth 设置为文件的路径（使用 bash 参数扩展和后缀模式匹配）。 然后我们使用这个 payth 变量来获取最后一个目录（利用 bash 参数扩展和前缀模式匹配）将其读入变量 samp。 这个变量 samp 最终在复制命令中用作文件名。