[英]How can I use file names as an input?
我写了一个 python 脚本(带有 pandas 库)来创建 txt 文件。 我还使用 txt 文件作为输入。 它运作良好,但我想让它更加自动化。
我的代码开始像;
girdi = input("Lütfen gir: ")
input2 = girdi+".txt"
veriCNR = pd.read_table(
input2, decimal=",",
usecols=[
"Chromosome",
"Name",
.
.
.
我正在一一输入文件的名称并获得如下输出:
.
.
.
outputCNR = girdi+".cnr"
sonTabloCNR.to_csv(outputCNR, sep="\t", index=False)
outputCNS = girdi+".cns"
sonTabloCNS.to_csv(outputCNS, sep="\t", index=False)
outputCNG = girdi+".genemetrics.cns"
sonTabloCNG.to_csv(outputCNG, sep="\t", index=False)
如您所见,我也将输入名称用于输出。 它们是制表符分隔的 txt 文件,具有不同的文件扩展名。
我想使用文件夹中的所有 txt 文件作为输入,并为每个文件运行此脚本。
我希望我解释清楚。
附言。 我不是程序员。 请用代码解释:)
您可以将创建文件的代码放在将文件路径作为输入的 function 中:
def generate_results(input_filepath):
# your code generating the files
然后您可以在循环中使用此 function 来生成所有结果文件。
这是一个使用glob获取directory
中所有文本文件的示例
import os
import glob
directory = "path to my directory"
for filepath in glob.glob(os.path.join(directory, "*.txt")):
generate_results(filepath)
如果要遍历文件夹中的文件,请使用os.listdir(path)
。 它返回路径上的文件名列表(默认为当前目录)。
例如:
import os
supported_extensions = ['.cns', '.cnr']
for filename in os.listdir():
# Make sure file has desired extension
if os.path.splitext(filename)[1] in supported_extensions:
function(filename)
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