仅从给定序列打印字符直到某个范围。 如何在 Python 中做到这一点？

Question

我有一个文件，其中有一系列字符。 我想读取该文件的第二行，并且只想将该行的字符读取到某个范围内。

我试过这段代码，但是，它只打印两行中的特定字符。 并且不打印范围。

with open ("irumfas.fas", "r") as file:
    first_chars = [line[1] for line in file if not line.isspace()]
    print(first_chars)

任何人都可以在这方面提供帮助吗？ 我怎样才能给出一个范围？ 下面提到了我要打印的序列。但我想从序列的第二行开始打印字符，直到某个范围。

IRUMSEQ ATTATAAAAATTAAAATTATATCCAATGAATTCAATTAAATTAAATTAAAGAATTCAATAATATACCCCGGGGGGATCCAATTAAAAGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Answer 1

您可以像切片列表一样切片文件中的 line[1]。

你非常接近：

end = 6 # number of characters
with open ("irumfas.fas", "r") as file:
    first_chars = [line[1][:end] for line in file if not line.isspace()]
    print(first_chars)

Answer 2

我想你想要这样的东西：

with open("irumfas.fas", "r") as file:
    second_line = file.readlines()[1]
    print(second_line[0:9])

readlines()将为您提供行列表——我们对其进行索引以仅获取第二行。 您现有的代码将遍历所有行（这不是您想要的）。

至于提取某个范围，您可以使用列表切片到select从该行中您想要的字符范围 - 在上面的示例中，它是前 10 个。

Answer 3

可以使用以下方法。 考虑文件包含

RANDOMTEXTSAMPLE
SAMPLERANDOMTEXT
RANDOMSAMPLETEXT

with open('sampleText.txt') as sampleText:
    content = sampleText.read()
    content = content.split("\n")[1]
    content = content[:6]
    print(content)

Output 将

SAMPLE