在以 python 中的特定字符开头和结尾的字符串中查找并打印 substring 的索引

Question

今天是个好日子！

可以说我有一个字符串，例如：

seq = 'ggtctgaatcgggtcaattggcccgctgagggtcaagtaccgggtgacatttgagcatgagtagatcgaggstggccagtatgcaaacggccgattgacgttaaggctaagcctaaaggtccacaggtcagtccagttagcattcgagtctaacggtatcggatctatttcggaaaaggctcatacgcgatcatgcggtccagagcgtac'

在这个字符串中，我有一个以atgca开头和结尾的特定序列（子字符串）：

'atgca......atgca' # there can be any letters in between them

如何打印atgca的索引？ 我想打印出现在上面给出的 substring 开头的 atgca 索引，以及出现在 substring 结尾的 atgca 索引。

任何帮助表示赞赏！

Answer 1

内置的“查找”function 正是这样做的：

start = 0
while start < len(seq):
    index = seq.find('atgca', start)
    if index == -1:
        break
    print index
    start = index + 1

Answer 2

你能修改上面的代码，每次循环时只检查开始和结束吗？ 我还添加了一个 not index1 和 not index2，因为您需要解决如果 find 返回 None 会发生什么。

start = 0
while start < len(seq):
    index1 = seq.find('atgca', start)
    if index1 == -1 or not index1:   
        break
    start = index1
    index2 = seq.find('atgca',start)
        if not index2:
            break
    print index1, index2
    start = index2 + 1

现在您有了两个索引，如果需要，您甚至可以打印位于两者之间的字符串部分。