Bash - 移动包含特定字符串的文件

Question

我有两个文件夹： Controls和Patients 。 在每一个里面都有几个文件夹，用于不同的个人（ CO1 ， CO2 ），与这个组织：

   Controls

   └───C01
   │   └───ROIS 
   │       └───rs_rois (imgs inside)
   │   └───Cortical_masks
   │       └─── accumbens
   │       └─── putamen
   │       └─── caudatus
   │   
   └───C02
   │   └───ROIS 
   │       └───rs_rois (imgs inside)
   │   └───Cortical_masks
   │       └─── accumbens
   │       └─── putamen
   │       └─── caudatus

对Patients也是如此

我想根据名称的 ZE83AED3DDF4667DEC0DAAAACB2BB3BE0BZ 将 imgs 从rs_rois移动到Cortical_masks文件夹。 因此，例如L_accumbens_rsfmri文件应该 go 到accumbens文件夹， R_caudate_rsfmri应该 go 到caudate文件夹。

这就是我所拥有的：

#!/bin/bash
DIR="/media/roy"; cd "$DIR/Analysis" || exit
for group in Controls Patients; do
    for case in "$group"/*; do
        for file in $DIR/Analysis/$case/ROIS2/rs_roi/*; do
            if grep -q accumbens "$file"; then
                mv $file $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/accumbens
            elif grep -q putamen "$file"; then
                mv $file $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/putamen
            elif grep -q caudate "$file"; then
                mv $file $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/caudate
            fi
        done;
    done;
done;

这个脚本没有做任何事情，这是为什么呢？ 如果我添加一些echo语句，我可以看到for file循环遍历了我的所有文件，但代码永远不会到达mv语句。

Answer 1

问题是您使用的grep表达式在文件内容而不是文件名中查找字符串（ accumbens等）。

用if [[ $file =~ accumbens ]]之类的模式匹配替换每个grep ...

然后脚本变为：

#!/bin/bash
DIR="/media/roy"; cd "$DIR/Analysis" || exit
for group in Controls Patients; do
    for case in "$group"/*; do
        for file in $DIR/Analysis/$case/ROIS2/rs_roi/*; do
            if [[ $file =~ accumbens ]]; then
                mv $file $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/accumbens
            elif [[ $file =~ putamen ]]; then
                mv $file $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/putamen
            elif [[ $file =~ caudate ]]; then
                mv $file $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/caudate
            fi
        done;
    done;
done;

Answer 2

使用find 。

#!/bin/bash
cd /path/to/Analysis/
for group in Control Patients; do
  for case in "$group"/*; do
    orig="$group/$case/ROIS/rs_rois"
    dest="$group/$case/Cortica_masks"
    find "$orig" -type f -name '*accumbens*' -exec mv {} "$dest" \;
    find "$orig" -type f -name '*putamen*' -exec mv {} "$dest" \;
    find "$orig" -type f -name '*caudate*' -exec mv {} "$dest" \;
  done
done

这是一种不需要字符串比较的清晰方法。

Answer 3

像这样的东西会起作用吗？

制作一个包含所需字符串的 file.txt

cat file.txt

caudate

putamen

然后

while read p; do mv $p $DIR/Analysis/$case/Cortical_masks/${p} done < file.txt